1/适用範圍:
适用于快速提取各種全血/血清/血漿/液體(tǐ)樣本miRNA和(hé)總RNA。
2/試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成
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保存
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50次(RE145-01)
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Lysis buffer
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4°C避光
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50 ml
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70%乙醇
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室溫
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9ml RNase-free H2O
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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漂洗液A
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室溫
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12 ml
第一次使用前加入28ml無水(shuǐ)乙醇
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漂洗液B
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室溫
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10 ml
第一次使用前加入42ml無水(shuǐ)乙醇
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RNase-free H2O
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室溫
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10 ml
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吸附柱AC和(hé)收集管CT
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室溫
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50套
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microRNA吸附柱MA
和(hé)收集管CT
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室溫
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50套
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本試劑盒按照指示儲存6個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。
3/儲存事項
1、漂洗液A和(hé)漂洗液B加入無水(shuǐ)乙醇後,可(kě)以在常溫保存。
2、漂洗液B可(kě)能加入乙醇使用幾天後出現沉澱晶體(tǐ),并不影(yǐng)響使用,直接不吸晶體(tǐ),吸上(shàng)清使用就可(kě)以。
3、運輸在常溫下進行(xíng),不影(yǐng)響使用效果。
4、避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、PH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。
4/産品介紹:
近年來(lái)對RNA幹擾和(hé)調節性小(xiǎo)RNA的廣泛研究迫切需要一種能有(yǒu)效提取15-30核苷酸左右大(dà)小(xiǎo)RNA(包括siRNA和(hé)miRNA)的試劑盒。但(dàn)是傳統的RNA提取方法如矽膠膜不能有(yǒu)效吸附回收,酚/胍抽提和(hé)乙醇沉澱并不能有(yǒu)效沉澱回收微小(xiǎo)分子RNA,對于血液樣本更是由于其自身特點更難提取。本試劑盒采用獨特的裂解液迅速直接裂解全血(液體(tǐ)樣本)和(hé)滅活細胞RNA酶,強烈有(yǒu)機抽提去除蛋白和(hé)DNA,RNA包括微小(xiǎo)分子RNA吸附于離心柱內(nèi)特殊矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟,漂洗液将細胞代謝物,蛋白等雜質進一步去除, 最後低(dī)鹽的洗脫液将純淨RNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。
5/産品特點:
1、離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用世界著名公司特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。
2、不需要乙醇沉澱等容易喪失微小(xiǎo)分子RNA的步驟。
3、獨有(yǒu)的裂解液配方,可(kě)直接裂解全血,不需要先裂解去除紅細胞。
4、多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.9~2.0,基本無DNA殘留。可(kě)用于RNAi,RT-PCR,Northern-blot和(hé)各種實驗。
6/注意事項:
1、第一次使用前請(qǐng)先在70%乙醇、漂洗液A瓶和(hé)漂洗液B瓶中加入指定量乙醇,加入後請(qǐng)及時(shí)打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!
2、所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000 rpm的傳統台式離心機。
3、需要自備乙醇,氯仿。
4、Lysis buffer和(hé)漂洗液A含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗
5、預防RNase 污染,應注意以下幾方面:
- ① 經常更換新手套。因為(wèi)皮膚經常帶有(yǒu)細菌,可(kě)能導緻RNase 污染。
- ② 使用無RNase 的塑料制(zhì)品和(hé)槍頭避免交叉污染。
- ③ RNA 在裂解液中時(shí)不會(huì)被RNase 降解。但(dàn)提取後繼續處理(lǐ)過程中應使用不含RNase 的塑料和(hé)玻璃器(qì)皿。玻璃器(qì)皿可(kě)在150℃烘烤4小(xiǎo)時(shí),塑料器(qì)皿可(kě)在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鍾,然後用水(shuǐ)徹底清洗,再滅菌,即可(kě)去除RNase。
- ④ 配制(zhì)溶液應使用無RNase 的水(shuǐ)。(将水(shuǐ)加入到幹淨的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%( v/v),37℃放置過夜,高(gāo)壓滅菌。)
5、RNA 純度及濃度檢測:
完整性:RNA 可(kě)用普通(tōng)瓊脂糖凝膠電(diàn)泳 (電(diàn)泳條件:膠濃度1.2%;0.5×TBE電(diàn)泳緩沖液;150v,15分鍾)檢測完整性。由于細胞中70%-80%的RNA 為(wèi)rRNA,電(diàn)泳後UV 下應能看到非常明(míng)顯的rRNA 條帶。動物rRNA 大(dà)小(xiǎo)分别約為(wèi)5 kb 和(hé)2kb,分别相當于28S和(hé)18S rRNA。動物RNA 樣品中最大(dà)rRNA 亮度應為(wèi)次大(dà)rRNA亮度的1.5-2.0 倍,否則表示RNA 樣品的降解。出現彌散片狀或條帶消失表明(míng)樣品嚴重降解。
純度:OD260/OD280比值是衡量蛋白質污染程度的指标。高(gāo)質量的RNA,OD260/OD280讀數(shù)(10mMTris, pH7.5)在1.8-2.1 之間(jiān)。OD260/OD280讀數(shù)受測定所用溶液的pH 值影(yǐng)響。同一個(gè)RNA 樣品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中測出的OD260/OD280 讀數(shù)1.8-2.1 之間(jiān),在水(shuǐ)溶液中所測讀數(shù)則可(kě)能在1.5-1.9 之間(jiān),但(dàn)這并不表示RNA 不純。
濃度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水(shuǐ)稀釋n 倍,用RNase-free水(shuǐ)将分光光度計(jì)調零,取稀釋液進行(xíng)OD260,OD280測定,按照以下公式進行(xíng)RNA濃度的計(jì)算(suàn):終濃度(ng/μl)= (OD260)×(稀釋倍數(shù)n)×40。
7/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)
提示:第一次使用前請(qǐng)先在70%乙醇、漂洗液A瓶和(hé)漂洗液B瓶中加入指定量乙醇!
1、每0.25ml液體(tǐ)樣品(血清,血漿,腦(nǎo)脊液等等)加入0.75ml Lysis buffer,用加樣槍吹打液體(tǐ)樣品幾次以幫助裂解樣品中細胞。每5~10×106個(gè)細胞至少(shǎo)加入0.75ml Lysis buffer。對于含有(yǒu)高(gāo)污染物樣品如全血樣品,可(kě)以用滅菌水(shuǐ)按照1:1比例稀釋一倍後開(kāi)始提取。Lysis buffer和(hé)液體(tǐ)樣品的終體(tǐ)積比總是3:1。
2、将樣品劇(jù)烈震蕩混勻,在15 -30°C條件下孵育5分鍾以使核蛋白體(tǐ)完全分解。
3、每0.75ml Lysis buffer加0.2 ml氯仿,劇(jù)烈振蕩15秒(miǎo)并室溫下放置2分鍾。
4、于4℃12,000 rpm 離心10分鍾,樣品會(huì)分成三層:下層有(yǒu)機相,中間(jiān)層和(hé)上(shàng)層無色的水(shuǐ)相,RNA存在于水(shuǐ)相中。水(shuǐ)相層的容量大(dà)約為(wèi)所加Lysis buffer體(tǐ)積的70%。
5、小(xiǎo)心取上(shàng)清(精确計(jì)算(suàn)體(tǐ)積)轉入到新的離心管,加入1.5倍體(tǐ)積的無水(shuǐ)乙醇(必須是室溫的),渦旋混勻。此時(shí)可(kě)能出現沉澱,但(dàn)是不影(yǐng)響提取過程,立即吹打混勻,不要離心,立刻接下步。
6、将混合物(每次小(xiǎo)于700μl,多(duō)可(kě)以分兩次加入)加入一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱AC放入收集管CT中)12,000 rpm離心30-60秒(miǎo),棄掉廢液。
7、加700μl 漂洗液A(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
8、加入500μl 漂洗液B(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。加入500μl 漂洗液B,重複一遍。
9、将吸附柱AC放回空(kōng)收集管CT中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。
10、取出吸附柱AC,放入一個(gè)RNase free離心管中,根據預期RNA産量在吸附膜的中間(jiān)部位加30-50μl RNase free water(事先在 100℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好), 室溫放置1分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。
11、如果預期RNA産量>30μg,加30-50μl RNase free water重複步驟10, 合并兩次洗脫液,或者使用第一次的洗脫液加回到吸附柱重複步驟一遍(如果需要RNA濃度高(gāo))。
洗脫兩遍的RNA洗脫液濃度高(gāo), 分兩次洗脫合并洗脫液的RNA産量比前者高(gāo)1 5–30%, 但(dàn)是濃度要低(dī),用戶根據需要選擇。
8/附:microRNA富集方法(僅僅提取microRNA,不包含>200 nt其它總RNA成份。)
1、按照前面标準操作(zuò)步驟1-5操作(zuò),直到得(de)到上(shàng)清。
2、較精确估計(jì)上(shàng)清體(tǐ)積,加入等體(tǐ)積70%乙醇(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!)(必須是室溫的),渦旋或者吹打充分混勻,不要離心。
3、将混合物加入一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱AC放入收集管CT中)12,000 rpm離心30-60秒(miǎo),收集濾過物。将濾過物從收集管CT轉移到一個(gè)新的離心管後,把吸附柱子放回空(kōng)的收集管CT內(nèi),再加入剩下的混合物,離心,收集濾過物。合并兩次濾過物,計(jì)算(suàn)體(tǐ)積。此時(shí),濾過物含有(yǒu)microRNA, 吸附柱子上(shàng)面是除去了microRNA的總RNA(不包含microRNA),如果需要,可(kě)以按照前面标準操作(zuò)步驟7-10操作(zuò)漂洗,洗脫回收得(de)到去除了microRNA的總RNA。
4、較精确估計(jì)濾過物體(tǐ)積,加入0.65倍體(tǐ)積無水(shuǐ)乙醇(必須是室溫的),渦旋或者吹打充分混勻,不要離心。
5、取一套新的microRNA吸附柱MA, 将上(shàng)一步驟混合物(每次小(xiǎo)于700μl,多(duō)可(kě)以分兩次加入)加入microRNA吸附柱MA中,(吸附柱放入收集管CT中)12,000 rpm離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
6、按照前面标準操作(zuò)步驟7-10操作(zuò)漂洗,洗脫得(de)到富集的microRNA。
注意:不同的實驗可(kě)以選擇不同的方法,例如Northern Blot或者表達芯片譜分析可(kě)以選擇提取包括microRNA的總RNA。富集方法提取的microRNA因為(wèi)去除了較大(dà)片段的mRNA和(hé)rRNA等,可(kě)能減少(shǎo)某些(xiē)下遊試驗的擴增背景,當背景較高(gāo)或者非特異擴增較多(duō)時(shí),可(kě)以嘗試使用富集方法提取的microRNA。