目錄号:PE106
适用範圍:
适用于5-15ml 中等規模質粒制(zhì)備(mind preparations)。
試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成
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保存
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50次(PE106-01)
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平衡液BS
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室溫
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5ml
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RNase A(10mg/ml)
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4℃
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250µl
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溶液A
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4℃
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25 ml
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溶液B
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室溫
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25 ml
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溶液C
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室溫
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25ml
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去蛋白液PS
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室溫
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16ml
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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漂洗液WB
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室溫
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13ml
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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洗脫緩沖液EB
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室溫
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15ml
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吸附柱AD
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室溫
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50個(gè)
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收集管CT(2ml)
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室溫
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50個(gè)
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本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。
儲存事項:
1、Rnase A保存在即用型甘油緩沖液中,常溫運輸,收到後,不超過25℃室溫至少(shǎo)保存6個(gè)月,4℃保存12個(gè)月,長期保存放-20℃
2、第一次使用時(shí),将試劑盒所帶的全部RNase A加入溶液A後(終濃度100ug/ml)置于2-8℃保存。如果溶液A中RNase A失活,提取的質粒可(kě)能會(huì)有(yǒu)微量RNA殘留,在溶液A中補加RNase A即可(kě)。
3、環境溫度低(dī)時(shí)溶液B中SDS可(kě)能會(huì)析出渾濁或者沉澱,可(kě)在37℃水(shuǐ)浴加熱幾分鍾,即可(kě)恢複澄清,不要劇(jù)烈搖晃,以免形成過量的泡沫。
4、避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。
産品介紹:
本試劑盒采用改進SDS-堿裂解法裂解細胞,質粒産量提高(gāo)1-2倍,離心吸附柱內(nèi)的矽基質膜在高(gāo)鹽、低(dī)pH值狀态下選擇性地結合溶液中的質粒DNA,再通(tōng)過去蛋白液和(hé)漂洗液将雜質和(hé)其它細菌成分去除,最後低(dī)鹽、高(gāo)pH值的洗脫緩沖液将純淨質粒DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。
産品特點:
1、特殊改進的高(gāo)産量緩沖液配方可(kě)以把質粒産量提高(gāo)1-2倍。
2、獨有(yǒu)的去蛋白液配方,可(kě)以高(gāo)效去除殘留的核酸酶,即使是核酸酶含量豐富的菌株如JM系列、HB101也可(kě)以輕松去除。有(yǒu)效防止了質粒被核酸酶降解。
3、快速、方便,不需要使用有(yǒu)毒的苯酚、氯仿等試劑,也不需要乙醇沉澱。獲得(de)的質粒産量高(gāo)、純度好, 可(kě)以直接用于酶切、轉化、PCR、體(tǐ)外轉錄、測序等各種分子生(shēng)物學實驗。
注意事項
1、所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000rpm的傳統台式離心機。
2、提取質粒的量與細菌培養濃度、質粒拷貝數(shù)等因素有(yǒu)關。一般高(gāo)拷貝質粒,建議取5-15 ml 過夜培養14-16個(gè)小(xiǎo)時(shí)的菌液,可(kě)提取出多(duō)達40µg-90µg的純淨質粒。如果所提質粒為(wèi)低(dī)拷貝質粒或大(dà)于10kb的大(dà)質粒,應适當加大(dà)菌體(tǐ)使用量,同時(shí)按比例增加A、B、C的用量,其它步驟相同。
3、得(de)到的質粒DNA可(kě)用瓊脂糖凝膠電(diàn)泳和(hé)紫外分光光度計(jì)檢測濃度與純度。OD260值為(wèi)1相當于大(dà)約50μg/ml DNA。電(diàn)泳可(kě)能為(wèi)單一條帶,也可(kě)能為(wèi)2條或者多(duō)條DNA條帶,這主要是不同程度的超螺旋構象質粒泳動位置不一造成,與提取物培養時(shí)間(jiān)長短(duǎn)、提取時(shí)操作(zuò)劇(jù)烈程度等有(yǒu)關。本公司産品正常操作(zuò)情況下基本超螺旋可(kě)以超過90%。
4、質粒DNA确切分子大(dà)小(xiǎo), 必須酶切線性化後,對比DNA分子量Marker才可(kě)以知道(dào)。處于環狀或者超螺旋狀态的的質粒,泳動位置不确定,無法通(tōng)過電(diàn)泳知道(dào)其确切大(dà)小(xiǎo)。
5、洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA,不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫,但(dàn)應該确保pH大(dà)于7.5,pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫質粒應該保存在-20℃。質粒DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。
關于平衡液BS的使用
介紹:核酸吸附矽膠膜柱子長期放置過程中會(huì)同空(kōng)氣中的電(diàn)荷/塵埃發生(shēng)反應而影(yǐng)響其核酸的結合能力。矽膠柱經平衡液BS預處理(lǐ)後可(kě)大(dà)大(dà)減少(shǎo)柱子中矽膠膜的憎水(shuǐ)基團,提高(gāo)核酸的結合能力。從而提高(gāo)矽膠柱子回收效率或者産量。平衡液BS是強堿性溶液,若不小(xiǎo)心碰到,請(qǐng)用大(dà)量自來(lái)水(shuǐ)清洗。用完後需蓋緊瓶蓋,以免接觸空(kōng)氣。室溫保存。在保存過程中可(kě)能有(yǒu)沉澱生(shēng)成,請(qǐng)加熱至37℃使沉澱完全消失。
使用方法:取一個(gè)新的矽膠膜吸附柱子裝在收集管CT中,吸取100μl的平衡液BS至柱子中。12000 rpm離心1分鍾,倒掉收集管CT中廢液,将吸附柱子重新放回收集管CT。此時(shí)平衡液BS預處理(lǐ)柱子完畢。接後續的操作(zuò)步驟。
操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)
提示:
● 第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB和(hé)去蛋白液PS瓶中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!
● 将RNase A全部加入溶液A中,混勻,每次使用後置于2-8℃保存。
1、取5-15 ml過夜培養的菌液,9,000rpm離心1-2分鍾,盡可(kě)能的倒幹上(shàng)清,收集菌體(tǐ)。
2、用500μl溶液A重懸菌體(tǐ)沉澱,渦旋振蕩至徹底懸浮,全部轉入一個(gè)2ml離心管。
如果有(yǒu)未徹底混勻的菌塊,會(huì)影(yǐng)響裂解,導緻提取量和(hé)純度偏低(dī)。
3、加500μl的溶液B,溫和(hé)地上(shàng)下翻轉6-8次使菌體(tǐ)充分裂解,室溫放置4分鍾。
溫和(hé)地混合,不要劇(jù)烈震蕩,以免基因組DNA剪切斷裂!所用時(shí)間(jiān)不應超過5分鍾!以免質粒受到破壞。此時(shí)菌液應變得(de)清亮粘稠,如果菌體(tǐ)少(shǎo),很(hěn)快清亮粘稠後就可(kě)以做(zuò)下一步,不是一定要準确的5分鍾。
4、加500μl溶液C,立即溫和(hé)地上(shàng)下翻轉6-8次,充分混勻時(shí)會(huì)出現白色絮狀沉澱。冰上(shàng)靜置3-5分鍾,12,000rpm離心10分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清。
5、加入溶液C後應該立即混勻,以免産生(shēng)SDS的局部沉澱。如果上(shàng)清中還(hái)有(yǒu)微小(xiǎo)白色沉澱,可(kě)再次離心後取上(shàng)清。
平衡液BS預處理(lǐ)吸附柱:
使用平衡液BS預處理(lǐ)矽膠膜吸附柱為(wèi)必做(zuò)步驟,具體(tǐ)方法參見前文“關于平衡液BS的使用”
6、将上(shàng)層水(shuǐ)相中加入0.5體(tǐ)積異丙醇(約740ul)後充分颠倒混勻後分多(duō)次(每次不超過700ul)轉入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm離心1分鍾,倒掉收集管中的廢液。直到所有(yǒu)混合溶液通(tōng)過此吸附柱。
7、加入500μl去蛋白液PS(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。
此步驟為(wèi)了去除痕量核酸酶等雜質,如所用菌株為(wèi)JM系列、HB101等endA菌株或野生(shēng)型菌株,核酸酶含量豐富,應加此步驟;如所用菌株為(wèi)XL-1 Blue和(hé)DH5α等缺陷型菌株,核酸酶含量低(dī),則可(kě)略過此步驟。
8、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
9、将吸附柱AD放回空(kōng)收集管CT中,12,000rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。
10、取出吸附柱AD,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl-250洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水(shuǐ)浴中加熱效果更好),室溫放置2-5分鍾,12,000rpm 離心1分鍾。如果需要較多(duō)量質粒,可(kě)将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,離心1分鍾。
洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo)。如果需要質粒濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于100μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)質粒洗脫效率,減少(shǎo)質粒産量。