适用範圍:
适用于快速從福爾馬林固定、石蠟包埋組織樣品中提取總RNA,RNA可(kě)用于反轉錄PCR,熒光定量PCR。
試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成
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保存
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50次(RE126-01)
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裂解液PKD
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室溫
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15 ml
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結合液RBC
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室溫
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25 ml
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漂洗液RB
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室溫
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10ml
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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蛋白酶K粉
40mg/ml
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-20℃
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20mg
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RNase-free H2O
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室溫
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10 ml
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基因組DNA清除柱CC和(hé)收集管CT
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室溫
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50套
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RNA吸附柱AC和(hé)收集管CT
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室溫
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50套
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本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。
儲存事項:
1、所有(yǒu)的溶液應該是澄清的,如果環境溫度低(dī)時(shí)溶液可(kě)能形成沉澱,此時(shí)不應該直接使用,可(kě)在37℃水(shuǐ)浴加熱幾分鍾,即可(kě)恢複澄清。
2、不合适的儲存于低(dī)溫(4℃或者-20℃)會(huì)造成溶液沉澱,影(yǐng)響使用效果,因此運輸和(hé)儲存均在室溫下(15℃-25℃)進行(xíng)。
3、為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入0.5毫升滅菌水(shuǐ)溶解(終濃度40mg/ml)。因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量)分裝凍存,-20℃保存。
4、避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、PH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。
産品介紹:
本試劑盒設計(jì)用于快速從福爾馬林固定、石蠟包埋組織樣品中提取總RNA。獨特的裂解液/蛋白酶K迅速裂解細胞釋放出RNA,然後裂解混合物通(tōng)過一個(gè)基因組DNA清除柱,基因組DNA被清除而RNA穿透濾過。濾過的RNA用乙醇調節結合條件後,RNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 去蛋白液和(hé)漂洗液将細胞代謝物,蛋白等雜質去除, 最後低(dī)鹽的RNase free H20将純淨RNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。得(de)到的RNA可(kě)用于反轉錄PCR、熒光定量PCR等實驗。
産品特點:
1、完全不使用有(yǒu)毒的苯酚,氯仿等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。
2、快速,簡捷,單個(gè)樣品RNA提取操作(zuò)一般可(kě)在1小(xiǎo)時(shí)內(nèi)完成。
3、試劑盒的獨家(jiā)基因組清除柱和(hé)配方确保有(yǒu)效清除基因組DNA殘留,一般情況下得(de)到的RNA不需要DNase消化,可(kě)直接用于反轉錄PCR、熒光定量PCR等實驗。
4、多(duō)次柱漂洗确保RNA高(gāo)純度,可(kě)直接用于下遊各種實驗。
注意事項
1、所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000 rpm的傳統台式離心機。
2、樣品處理(lǐ)量絕對不要超過基因組DNA清除柱CC和(hé)RNA吸附柱AC處理(lǐ)能力,否則造成DNA殘留或者産量降低(dī)。不同組織細胞種類RNA/DNA相差極大(dà),例如胸腺脾髒DNA含量豐富,超過5mg就會(huì)超過柱子處理(lǐ)能力。COS細胞RNA含量豐富,超過3x106細胞就會(huì)超過柱子吸附能力。所以開(kāi)始摸索實驗條件時(shí),如果不清楚樣品DNA/RNA含量時(shí)甯可(kě)使用較少(shǎo)的樣品處理(lǐ)量,如不超過2個(gè)10μm厚度石蠟切片。将來(lái)根據樣品試驗情況增加或者減少(shǎo)處理(lǐ)量。
3、裂解液PKD、結合液RBC中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗
4、預防RNase 污染,應注意以下幾方面:
① 經常更換新手套。因為(wèi)皮膚經常帶有(yǒu)細菌,可(kě)能導緻RNase 污染。
② 使用無RNase 的塑料制(zhì)品和(hé)槍頭避免交叉污染。
③ RNA提取過程中應使用不含RNase 的塑料和(hé)玻璃器(qì)皿。玻璃器(qì)皿可(kě)在150℃烘烤4 小(xiǎo)時(shí),塑料器(qì)皿可(kě)在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鍾,然後用水(shuǐ)徹底清洗,再滅菌,即可(kě)去除RNase。
④ 配制(zhì)溶液應使用無RNase 的水(shuǐ)。(将水(shuǐ)加入到幹淨的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%( v/v),37℃放置過夜,高(gāo)壓滅菌。)
5、關于DNA 的微量殘留:
一般說來(lái)任何總RNA提取試劑在提取過程中無法完全避免DNA的微量殘留(DNase消化也無法做(zuò)到100%無殘留),本公司的GenePure固定包埋組織RNA快速提取試劑盒,由于采取了本公司獨特的緩沖體(tǐ)系和(hé)基因組DNA清除柱技(jì)術(shù),絕大(dà)多(duō)數(shù)DNA已經被清除,可(kě)直接用于反轉錄PCR和(hé)熒光定量PCR。個(gè)别特殊情況如DNA含量過于豐富造成殘留或者要進行(xíng)嚴格的mRNA表達量分析熒光定量PCR,我們建議在進行(xíng)模闆和(hé)引物的選擇時(shí):
① 選用跨內(nèi)含子的引物,以穿過mRNA中的連接區(qū),這樣DNA就不能作(zuò)為(wèi)模闆參與擴增反應。
② 選擇基因組DNA和(hé)cDNA上(shàng)擴增的産物大(dà)小(xiǎo)不一樣的引物對。
6、RNA 純度及濃度檢測:
完整性: RNA 可(kě)用普通(tōng)瓊脂糖凝膠電(diàn)泳 (電(diàn)泳條件:膠濃度1.2%;0.5×TBE電(diàn)泳緩沖液;150v,15 分鍾)檢測完整性。由于石蠟包埋組織福爾馬林固定和(hé)包埋過程中一般由于RNA與蛋白反應交聯會(huì)導緻RNA斷裂或者降解,一般電(diàn)泳後UV 下隻能看到模糊彌散(smear)帶型,随着儲存的時(shí)間(jiān)越長,降解斷裂越嚴重,甚至隻能看到峰值僅僅在100bp左右的模糊條帶。這都屬于RNA提取正常情況。
純度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白質污染程度的參考指标。高(gāo)質量的RNA,OD260/OD280 讀數(shù)(10mMTris, pH7.5)在1.8-2.1 之間(jiān)。OD260/OD280 讀數(shù)受測定所用溶液的pH 值影(yǐng)響。同一個(gè)RNA 樣品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中測出的OD260/OD280 讀數(shù)1.8-2.1 之間(jiān),在水(shuǐ)溶液中所測讀數(shù)則可(kě)能在1.5-1.9 之間(jiān),但(dàn)這并不表示RNA 不純。
濃度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水(shuǐ)稀釋n 倍,用RNase-free水(shuǐ)将分光光度計(jì)調零,取稀釋液進行(xíng)OD260, OD280 測定,按照以下公式進行(xíng)RNA濃度的計(jì)算(suàn):終濃度(ng/μl)= (OD260)×(稀釋倍數(shù)n)×40。
操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)
提示:第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液RB瓶中加入指定量無水(shuǐ)乙醇!
1、修整去除過量包埋組織外石蠟,并切片成5-20μm厚切片(開(kāi)始的2-3片抛棄不用)。
2、收集總厚度不超過■40μm的石蠟切片到一個(gè)1.5-2ml離心管(例如2片20μm、4片10μm、8片5μm的石蠟切片),或者不超過▲80μm的石蠟切片到一個(gè)2ml離心管。
■代表處理(lǐ)切片總厚度≤40μm,▲代表處理(lǐ)切片總厚度≤80μm
3、加入1ml 100%二甲苯,渦旋振蕩10秒(miǎo)。瞬間(jiān)離心把組織全部浸入到二甲苯。
4、50℃水(shuǐ)浴3分鍾熔解石蠟,20-25℃最高(gāo)速離心2分鍾,收集組織到管底。
5、小(xiǎo)心用移液器(qì)吸棄上(shàng)清二甲苯,注意不要吸到沉澱。
6、加入1ml無水(shuǐ)乙醇,渦旋振蕩,最高(gāo)速離心2分鍾,小(xiǎo)心吸棄上(shàng)清乙醇。
7、加入1ml無水(shuǐ)乙醇,重複步驟6一遍,盡可(kě)能吸棄所有(yǒu)乙醇。
8、室溫或者37℃ 晾幹乙醇10分鍾或直到所有(yǒu)乙醇揮發幹。
乙醇完全晾幹非常重要,微量的乙醇殘留也會(huì)導緻RNA産量降低(dī)。
9、重懸吹打或者渦旋振蕩充分重懸組織沉澱在■150μl ▲240μl 裂解液PKD中,短(duǎn)暫離心收集液體(tǐ)到管底,加10μl 蛋白酶K,吹打混勻。
10、55℃孵育15分鍾,然後80 ℃孵育15分鍾。
55℃孵育後,可(kě)以将離心管取出放置在室溫,等水(shuǐ)浴鍋溫度升到80℃後再放入水(shuǐ)浴鍋,精确的孵育15分鍾。即使2分鍾的延長也可(kě)能導緻RNA的部分降解。
11、加入■320μl ▲500μl 結合液RBC,充分吹打混勻調節結合條件。
12、立刻将混合物加入一個(gè)基因組DNA清除柱CC中,(清除柱CC放入收集管CT中)14,000 rpm離心60秒(miǎo),保留濾過液(RNA在濾過液中)。
應避免吸到可(kě)能有(yǒu)的較大(dà)的未消化完全的絮團物質上(shàng)柱子,以免堵塞離心柱。
13、加入■720μl ▲1200μl 無水(shuǐ)乙醇到濾過液中,立即吹打混勻,不要離心。
14、立刻将混合物(每次小(xiǎo)于700μl,多(duō)可(kě)以分多(duō)次加入)加入一個(gè)RNA吸附柱AC中,(吸附柱AC放入收集管CT中)13,000 rpm離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
15、加入500μl漂洗液RB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。加入500μl漂洗液RB,重複一遍。
16、将吸附柱AC放回空(kōng)收集管CT中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。
17、取出吸附柱AC,放入一個(gè)RNase free離心管中,根據預期RNA産量在吸附膜的中間(jiān)部位加30μl RNase free water(事先在 70-90℃水(shuǐ)浴中加熱可(kě)提高(gāo)産量), 室溫放置1分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。
洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果需要RNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積,如果需要RNA濃度高(gāo),可(kě)以将洗脫液放回吸附柱AC,再洗脫一遍。