1/适用範圍:
适用于快速提取心髒、骨骼肌、血管、氣管、皮膚和(hé)其它纖維豐富的組織RNA。
2/試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成
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保存
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20次
(RE118-01)
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50次
(RE118-02)
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裂解液LBT
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室溫
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20ml
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50 ml
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去蛋白液PRS
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室溫
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15 ml
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40 ml
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漂洗液RB
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室溫
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5 ml 10ml
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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RNase-free H2O
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室溫
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20 ml
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40 ml
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蛋白酶K粉40mg/ml
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-20℃
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10mg
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20mg
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RNase-free
吸附柱AC和(hé)收集管CT
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室溫
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20套
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50套
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本試劑盒在室溫儲存6個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。
3/儲存事項:
1、所有(yǒu)的溶液應該是澄清的,如果環境溫度低(dī)時(shí)溶液可(kě)能形成沉澱,此時(shí)不應該直接使用,可(kě)在37℃水(shuǐ)浴加熱幾分鍾,即可(kě)恢複澄清。
2、不合适儲存于低(dī)溫(4℃或者-20℃)會(huì)造成溶液沉澱,影(yǐng)響使用效果,因此運輸和(hé)儲存均在室溫下(15℃-25℃)進行(xíng)。
3、為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入0.25ml (20次)和(hé)0.5ml (50次)RNase-free H2O溶解。因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後可(kě)立即按照每次使用量分裝凍存,-20℃保存。
4、避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、PH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。
4/産品介紹:
獨特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解細胞和(hé)滅活細胞RNA酶,然後用乙醇調節結合條件後,RNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜,再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 去蛋白液和(hé)漂洗液将細胞代謝物,蛋白等雜質去除, 最後低(dī)鹽的RNase free H2O将純淨RNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。
5/産品特點:
1、離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用世界著名公司特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。
2、不需要使用有(yǒu)毒的苯酚,氯仿等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。
3、快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在30分鍾內(nèi)完成。
4、多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.9~2.0,基本無DNA殘留,可(kě)用于RT-PCR,Northern-blot和(hé)各種實驗。
6/注意事項:
1、所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000 rpm的傳統台式離心機。
2、需要自備乙醇, β-巯基乙醇,一次性注射器(qì),研缽,水(shuǐ)浴鍋等。
3、裂解液LBT 和(hé)去蛋白液PRS中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。
4、預防RNase 污染,應注意以下幾方面:
- ① 經常更換新手套。因為(wèi)皮膚經常帶有(yǒu)細菌,可(kě)能導緻RNase 污染。
- ② 使用無RNase 的塑料制(zhì)品和(hé)槍頭避免交叉污染。
- ③ RNA 在裂解液LBT 中時(shí)不會(huì)被RNase 降解。但(dàn)提取後繼續處理(lǐ)過程中應使用不含RNase 的塑料和(hé)玻璃器(qì)皿。玻璃器(qì)皿可(kě)在150℃烘烤4 小(xiǎo)時(shí),塑料器(qì)皿可(kě)在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鍾,然後用水(shuǐ)徹底清洗,再滅菌,即可(kě)去除RNase。
- ④ 配制(zhì)溶液應使用無RNase 的水(shuǐ)。(将水(shuǐ)加入到幹淨的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%( v/v),37℃放置過夜,高(gāo)壓滅菌。)
5、關于DNA 的微量殘留:
一般說來(lái)任何總RNA提取試劑在提取過程中無法完全避免DNA的微量殘留,本公司的GenePure系列RNA提取産品,由于采取了本公司獨特的緩沖體(tǐ)系和(hé)選擇特殊吸附能力的吸附膜,在大(dà)多(duō)數(shù)RT-PCR 擴增過程中極其微量的DNA殘留(一般電(diàn)泳EB染色紫外燈下觀察不可(kě)見)影(yǐng)響不是很(hěn)大(dà), 如果要進行(xíng)嚴格的mRNA表達量分析如熒光定量PCR,我們建議在進行(xíng)模闆和(hé)引物的選擇時(shí):
- ① 選用跨內(nèi)含子的引物,以穿過mRNA中的連接區(qū),這樣DNA就不能作(zuò)為(wèi)模闆參與擴增反應。
- ② 選擇基因組DNA和(hé)cDNA上(shàng)擴增的産物大(dà)小(xiǎo)不一樣的引物對。
- ③ 将RNA提取物用RNase-free的DNase I 處理(lǐ)。本試劑盒還(hái)可(kě)以用于DNase I處理(lǐ)後的RNA清潔(cleanup),請(qǐng)聯系我們索取具體(tǐ)操作(zuò)說明(míng)書(shū)。
- ④ 在步驟去蛋白液PRS漂洗前,直接在吸附柱AC上(shàng)進行(xíng)DNase I處理(lǐ)。請(qǐng)聯系我們索取具體(tǐ)操作(zuò)說明(míng)書(shū)。
6、RNA 純度及濃度檢測:
完整性: RNA 可(kě)用普通(tōng)瓊脂糖凝膠電(diàn)泳 (電(diàn)泳條件:膠濃度1.2%;0.5×TBE電(diàn)泳緩沖液;150v,15 分鍾)檢測完整性。由于細胞中70%-80%的RNA 為(wèi)rRNA,電(diàn)泳後UV 下應能看到非常明(míng)顯的rRNA 條帶。動物rRNA 大(dà)小(xiǎo)分别約為(wèi)5 kb 和(hé)2kb,分别相當于28S 和(hé)18S rRNA。動物RNA 樣品中最大(dà)rRNA 亮度應為(wèi)次大(dà)rRNA亮度的1.5-2.0 倍,否則表示RNA 樣品的降解。出現彌散片狀或條帶消失表明(míng)樣品嚴重降解。
純度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白質污染程度的指标。高(gāo)質量的RNA,OD260/OD280 讀數(shù)(10mMTris, pH7.5)在1.8-2.1 之間(jiān)。OD260/OD280 讀數(shù)受測定所用溶液的pH 值影(yǐng)響。同一個(gè)RNA 樣品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中測出的OD260/OD280 讀數(shù)1.8-2.1 之間(jiān),在水(shuǐ)溶液中所測讀數(shù)則可(kě)能在1.5-1.9 之間(jiān),但(dàn)這并不表示RNA 不純。
濃度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水(shuǐ)稀釋n 倍,用RNase-free水(shuǐ)将分光光度計(jì)調零,取稀釋液進行(xíng)OD260,OD280 測定,按照以下公式進行(xíng)RNA濃度的計(jì)算(suàn):終濃度(ng/μl)= (OD260)×(稀釋倍數(shù)n)×40。
7/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)
提示:
● 第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液RB瓶和(hé)70%乙醇瓶中加入指定量無水(shuǐ)乙醇!
● 操作(zuò)前在裂解液LBT中加入β-巯基乙醇至終濃度1%,如1 ml LBT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好現用現配。配好的裂解液LBT 4℃可(kě)放置一個(gè)月。
1、分破碎勻漿(非常重要,否則嚴重降低(dī)産量)
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- 電(diàn)動破碎勻漿(首選強烈推薦,産量最高(gāo)結果最穩定):取約10-20mg(<30mg)新鮮組織,加入300μl裂解液LBT後用電(diàn)動刀片勻漿機(Rotor-Stator如TissueRupter)或者電(diàn)動玻珠研磨機(Bead Mill如TissueLyser)按照機器(qì)使用說明(míng)徹底破碎勻漿組織細胞。
- 液氮研磨+勻漿:在液氮中研磨組織成細粉後,取适量組織細粉10-20mg(<30mg)轉入裝有(yǒu)300μl裂解液LBT的1.5ml離心管中, 用手劇(jù)烈振蕩20秒(miǎo),充分裂解。用帶鈍針頭的一次性 1 ml(配0.9mm針頭) 注射器(qì)抽打裂解物 10 次或直到得(de)到滿意勻漿結果(或者電(diàn)動勻漿30秒(miǎo)) ,可(kě)以剪切DNA,降低(dī)粘稠度和(hé)提高(gāo)産量。講勻漿轉入新離心管。
- 研缽研磨勻漿: 取适量組織細粉10-20mg(<30mg)放入小(xiǎo)研缽後,迅速加入300μl裂解液LBT後直接室溫充分研磨勻漿。将勻漿轉入新離心管。
注意:如果勻漿沾在研缽內(nèi)損失比較大(dà),可(kě)以按照比例适當提高(gāo)起始組織用量和(hé)裂解液LBT用量。此外,也可(kě)以先用液氮研磨組織成細粉,然後液氮剛剛蒸發完的時(shí)候加入裂解液LBT充分研磨勻漿,可(kě)以提高(gāo)研磨效果。
2、吸取590μl RNase-free H2O至勻漿中。加入10μl蛋白酶K,移液器(qì)吹打混勻。
3、55℃下水(shuǐ)浴10分鍾。
4、室溫下以13,000rpm離心5分鍾。這樣将會(huì)形成小(xiǎo)量的組織碎片沉澱,而且在上(shàng)清的頂部可(kě)能看見少(shǎo)量的漂浮物。
5、轉移上(shàng)清至一個(gè)新的1.5ml離心管中。
注意:轉移時(shí)不要帶入沉澱物,而且移液槍頭必須放在上(shàng)清漂浮物之下。漂浮物通(tōng)常可(kě)能會(huì)黏附在槍頭的外壁,注意不能将其帶入離心管中。
6、較精确估計(jì)裂解物(上(shàng)清)體(tǐ)積,加入0.5體(tǐ)積的無水(shuǐ)乙醇(一般為(wèi)450μl),此時(shí)可(kě)能出現沉澱,但(dàn)是不影(yǐng)響提取過程,立即吹打混勻,不要離心。
7、立刻将混合物(每次小(xiǎo)于700μl,可(kě)以分兩次加入)加入同一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱AC放入收集管CT中)13,000 rpm離心60秒(miǎo),棄掉廢液。
8、加700μl 去蛋白液PRS,室溫放置30秒(miǎo),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
如果DNA殘留明(míng)顯,可(kě)在加入去蛋白液PRS後室溫放置5分鍾再離心。
9、加入500μl漂洗液RB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。加入500μl漂洗液RB,,重複一遍。
10、将吸附柱AC放回空(kōng)收集管CT中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。
11、取出吸附柱AC,放入一個(gè)RNase free離心管中,根據預期RNA産量在吸附膜的中間(jiān)部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水(shuǐ)浴中加熱可(kě)提高(gāo)産量), 室溫放置1分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。
12、可(kě)選:使用第一次的洗脫液加回到吸附柱重複步驟一遍(如果需要RNA濃度高(gāo))。
洗脫兩遍的RNA洗脫液RNA濃度可(kě)以适當提高(gāo)一些(xiē)。如果預期RNA産量>30μg,可(kě)加30-50μl RNase free water重複步驟11,合并兩次洗脫液,可(kě)以提高(gāo)産量15–30%,但(dàn)濃度會(huì)有(yǒu)所降低(dī)。