1/适用範圍:
适用于快速提取植物基因組DNA。
2/試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成
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保存
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10次(DE116-01)
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裂解液PB
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室溫
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100 ml
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結合液CL
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室溫
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30mlx2
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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抑制(zhì)物去除液IR
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室溫
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100 ml
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漂洗液WB
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室溫
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25 mlx2
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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洗脫緩沖液EB
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室溫
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15 mlx2
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吸附柱DA
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室溫
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10個(gè)
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收集管CT(50 ml)
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室溫
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10個(gè)
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本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。
3/儲存事項:
① 裂解液PB、結合液CL或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在55℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。
② 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。
4/産品介紹:
改進的經典CTAB植物DNA抽提液內(nèi)(添加多(duō)種針對植物特點的多(duō)糖、多(duō)酚去除成份)迅速裂解細胞和(hé)滅活細胞內(nèi)核酸酶,氯仿抽提後通(tōng)過離心清除多(duō)糖、多(duō)酚和(hé)蛋白質,然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜,再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 進一步将多(duō)糖、多(duō)酚和(hé)細胞代謝物、蛋白等雜質去除,最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。
5/産品特點:
① 離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。
② 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。
③ 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在1小(xiǎo)時(shí)內(nèi)完成。
④ 數(shù)種去多(duō)糖、多(duō)酚成份和(hé)多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,長度可(kě)達30 kb -50kb,可(kě)直接用于PCR,Southern-blot和(hé)各種酶切反應。
6/注意事項:
① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到9,000xg,可(kě)容納50ml離心管的台式離心機。
② 開(kāi)始實驗前将需要的水(shuǐ)浴先預熱到65℃備用。
③ 需要自備氯仿或者氯仿/異戊醇(體(tǐ)積比24:1混合)、無水(shuǐ)乙醇和(hé)β-巯基乙醇。
④ 結合液CL 和(hé)抑制(zhì)物去除液IR中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚、眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。
⑤ 不同來(lái)源的植物組織材料中提取DNA 的量會(huì)有(yǒu)差異,一般100mg新鮮組織典型産量可(kě)達3-25μg。
⑥ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA, 不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫, 但(dàn)應該确保pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫 (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。
7/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)
提示:
● 第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB和(hé)結合液CL中加入指定量的無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!
● 取所需适量裂解液PB放置在65℃預熱,使用前加入β-巯基乙醇到終濃度2%。
1、取适量植物組織(新鮮組織1-2克 或幹重組織0.3-0.4克)在研缽中加入液氮充分碾磨成細粉。
2、轉移細粉到一個(gè)50 ml離心管,不要解凍,加10 ml 65℃預熱的裂解液PB (确認已加入β-巯基乙醇至2%),劇(jù)烈渦旋振蕩混勻,用大(dà)口徑槍頭輕柔吹打幫助裂解。
如果組織裂解困難,可(kě)根據需要加一個(gè)輕柔勻漿10秒(miǎo)的步驟幫助裂解。
3、65℃水(shuǐ)浴30-60分鍾,在水(shuǐ)浴過程中颠倒離心管以混合樣品數(shù)次。
可(kě)選:如果組織幹燥或者産量低(dī),可(kě)以适當延長水(shuǐ)浴時(shí)間(jiān)。如果RNA殘留多(duō),可(kě)在水(shuǐ)浴前加入100μl RNA酶(20mg/ml)。
注:如果提取的DNA殘留RNA較多(duō)導緻電(diàn)泳時(shí)候條帶拖尾,條帶扭曲,背景很(hěn)高(gāo)等不正常電(diàn)泳情況,可(kě)以加1% RNA酶(10mg/ml)37℃或者室溫放置半小(xiǎo)時(shí)即可(kě)消化RNA,消化完後不需要特殊處理(lǐ)便可(kě)用于PCR或者酶切。
加入10 ml氯仿或者氯仿/異戊醇(體(tǐ)積比24:1混合),颠倒充分混勻幾分鍾(或者渦旋混勻),9,000xg 以上(shàng)離心10分鍾。
若提取的植物組織富含多(duō)糖多(duō)酚,可(kě)以在第4步前用等體(tǐ)積酚/氯仿(1:1)抽提一遍。
4、小(xiǎo)心吸取上(shàng)清到一個(gè)新的50 ml離心管,注意不要吸到界面物質。
如上(shàng)清比較渾濁,則需要重複步驟4一遍,直到得(de)到透亮上(shàng)清。
5、較精确估算(suàn)上(shàng)清量,加入1.5倍體(tǐ)積結合液CL (請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!)後立刻渦旋,充分混勻。此時(shí)可(kě)能出現沉澱,但(dàn)不影(yǐng)響實驗結果。
6、将上(shàng)一步所得(de)混合物(包括可(kě)能出現的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)靜置2分鍾, 9,000xg離心2分鍾,倒掉收集管CT中的廢液(每次最多(duō)可(kě)加20 ml混合物離心,棄廢液,再加入剩餘的溶液,再次離心)。
7、加入10 ml抑制(zhì)物去除液IR,9,000xg離心2分鍾,棄廢液。
8、加入10 ml漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),9,000xg離心2分鍾,棄掉廢液。
9、重複操作(zuò)步驟9一遍。
10、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,最高(gāo)速(最好大(dà)于9000xg,如果離心機轉速低(dī),需要相應延長離心時(shí)間(jiān))離心10-15分鍾以幹燥膜基質殘留乙醇,用槍頭吸除內(nèi)圈壓環和(hé)柱壁之間(jiān)可(kě)能殘留的乙醇,室溫或者烘箱晾幹幾分鍾。
該步驟目的為(wèi)徹底去除吸附柱中殘留乙醇,殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應并且嚴重降低(dī)洗脫效率,降低(dī)DNA産量。如果洗脫産量低(dī),則必須加做(zuò)步驟12。
11、可(kě)選步驟: 選擇以下兩種方法之一幹燥柱子:
(1)取下柱子放置于真空(kōng)容器(qì)中,密封真空(kōng)容器(qì),提供真空(kōng)15分鍾;
(2)将柱子放置于60-65℃真空(kōng)幹燥箱或烘箱中,放置10-15分鍾。
12、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加1.5-2ml洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好),室溫放置3-5分鍾分鍾,9000 xg離心4-5分鍾。如果需要較多(duō)量DNA,可(kě)将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,離心2分鍾。
洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果預計(jì)和(hé)需要産量高(gāo),可(kě)增大(dà)洗脫體(tǐ)積,如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于1ml,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。
13、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。