1/适用範圍:
适用于快速提取真菌組織細胞基因組DNA。
2/試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成
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保存
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50次
(DE128-01)
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100次
(DE128-02)
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RNase A(10mg/ml)
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-20℃
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250 μl
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500 μl
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緩沖液A
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室溫
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25 ml
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50 ml
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緩沖液B
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室溫
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10 ml
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20 ml
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緩沖液C
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室溫
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15 ml
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25 ml
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第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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漂洗液WB
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室溫
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15 ml
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25ml
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第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇
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洗脫緩沖液EB
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室溫
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15 ml
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20 ml
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吸附柱DA
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室溫
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50個(gè)
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100個(gè)
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收集管CT(2ml)
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室溫
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50個(gè)
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100個(gè)
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本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。
3/儲存事項:
① 緩沖液A、C低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在65℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解(緩沖液C加入乙醇前可(kě)加熱,加入乙醇後不可(kě)加熱),恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。
② 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。
4/産品介紹:
該試劑盒采用DNA吸附柱和(hé)新型獨特的溶液系統,适合于從真菌組織細胞中快速簡單地提取基因組DNA。可(kě)在30分鍾內(nèi)完成一個(gè)或多(duō)個(gè)100mg新鮮或20mg幹燥的真菌樣品DNA的純化工作(zuò)。提取過程不需要用到有(yǒu)毒的酚氯仿等有(yǒu)機物抽提,也不需要用到耗時(shí)的異丙醇或乙醇沉澱,并能快速高(gāo)效地去除多(duō)糖類、酚類和(hé)酶抑制(zhì)物等雜質,純化的DNA可(kě)直接用于PCR、酶切和(hé)雜交等實驗。
新鮮或幹燥的真菌組織(細胞)磨碎後經裂解液裂解;蛋白質、多(duō)糖、細胞殘片被沉澱去除;然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 進一步将多(duō)糖,多(duō)酚和(hé)細胞代謝物,蛋白等雜質去除, 最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。
5/産品特點:
① 離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。
② 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。
③ 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在1小(xiǎo)時(shí)內(nèi)完成。
④ 數(shù)種去多(duō)糖、多(duō)酚成份和(hé)多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,可(kě)直接用于PCR,Southern-blot和(hé)各種酶切反應。
6/注意事項:
① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000 rpm的傳統台式離心機。
② 開(kāi)始實驗前将需要的水(shuǐ)浴先預熱到65℃備用。
③ 緩沖液C中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。
④ 不同來(lái)源的真菌組織細胞材料中提取DNA 的量會(huì)有(yǒu)差異,一般100mg新鮮組織典型産量可(kě)達3-25μg。
⑤ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA, 不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫, 但(dàn)應該确保pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫 (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。
7/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)
提示:● 第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!
● 第一次使用前請(qǐng)先在緩沖液C中加入指定量無水(shuǐ)乙醇!
1、取适量真菌組織在研缽中加入液氮充分碾磨成細粉。
2、轉移細粉(新鮮真菌組織100 mg 或幹重組織20 mg)到一個(gè)1.5ml離心管,不要解凍,加入400μl緩沖液A 和(hé)4μl RNase A(10 mg/ml),旋渦振蕩,充分混勻幫助裂解。
如果組織裂解困難,可(kě)根據需要加一個(gè)輕柔勻漿10秒(miǎo)的步驟幫助裂解。大(dà)多(duō)數(shù)情況下不需要離心去除未完全裂解的組織,因為(wèi)後面有(yǒu)一個(gè)離心去除的步驟。
可(kě)選:多(duō)糖含量特别高(gāo)的時(shí)候可(kě)以在緩沖液A加入2%PVP40,000; 多(duō)酚含量特别高(gāo)的時(shí)候可(kě)以在緩沖液A中加入0.2% beta巯基乙醇。也可(kě)兩者同時(shí)加入。
3、65℃水(shuǐ)浴10分鍾,在水(shuǐ)浴過程中颠倒離心管2-3次,混合樣品。
4、加入130 μl 緩沖液B,充分混勻,冰上(shàng)放置5分鍾, 14,000 rpm 離心5-10 分鍾,小(xiǎo)心吸取上(shàng)清到一個(gè)新的1.5ml離心管,注意不要吸到界面物質。
5、計(jì)算(suàn)上(shàng)清量,加入1.5倍體(tǐ)積的緩沖液C(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),立即吹打混勻。
加入緩沖液C可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱,但(dàn)不影(yǐng)響DNA提取。注意将緩沖液C直接加入到上(shàng)清并立即吹打混勻。
6、将上(shàng)一步所得(de)混合物(包括可(kě)能出現的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000 rpm離心30-60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液(先加650μl離心,棄廢液,再加入剩餘的溶液,再次離心)。
7、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
8、加入600μl漂洗液WB,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
9、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。
10、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB, 室溫放置3-5分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000 rpm離心1分鍾。
洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果預計(jì)和(hé)需要産量高(gāo),可(kě)增大(dà)洗脫體(tǐ)積,如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于50μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。
11、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。
8/問題與解決方法
問題
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評論與建議
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DNA産量低(dī)
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*處理(lǐ)材料過量或者裂解不完全
-建議:使用适量的起始材料,充分研磨或者勻漿
*結合條件不恰當
-建議:步驟5精确估計(jì)上(shàng)清量,加入1.5倍體(tǐ)積緩沖液C量要準确
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RNA殘留
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*真菌RNA含量太豐富
-建議:提高(gāo)RNase A處理(lǐ)濃度
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未提取到DNA
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*漂洗液WB中忘記加無水(shuǐ)乙醇
-建議:第一次實驗時(shí),在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇。
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離心柱堵塞
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*研磨裂解不充分,團塊多(duō);裂解物太粘稠;離心力太小(xiǎo)
-建議:參見步驟2,加一個(gè)離心步驟去除;減低(dī)起始材料量,不要處理(lǐ)過量,加大(dà)離心力
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洗脫下來(lái)的
DNA溶液帶顔色
或者膜上(shàng)有(yǒu)明(míng)顯
的色素殘留
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*漂洗次數(shù)不夠
-建議:步驟8完成後,加500μl乙醇再漂洗一遍
*起始材料太多(duō)過量
-建議:減少(shǎo)起始處理(lǐ)材料,不要過量
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洗脫下來(lái)的
DNA産量低(dī)
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*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇
-建議:确保做(zuò)了步驟9,否則殘留乙醇會(huì)影(yǐng)響洗脫效率。
*使用了水(shuǐ)或者其它非最佳液體(tǐ)代替洗脫緩沖液
-建議:仔細閱讀步驟10和(hé)注意事項5和(hé)隻使用洗脫緩沖液EB洗脫。
*洗脫緩沖液量偏低(dī)
-建議:使用200μl洗脫緩沖液洗脫
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A260吸光值
異常偏高(gāo)
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*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),幹擾了吸光值
-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。
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DNA下遊酶切
不能切開(kāi)或者
酶切不完全
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*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),抑制(zhì)了酶切反應
-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。
*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇抑制(zhì)了酶切反應
-建議:确保做(zuò)了步驟9,然後空(kōng)氣中晾幾分鍾,讓殘留乙醇揮發。
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