固定包埋組織DNA快速提取試劑盒
DE134
50次、100次
适用于快速提取各種福爾馬林固定和(hé)石蠟包埋組織DNA
規格 價格
50次(帶蛋白酶K) ¥720
100次(帶蛋白酶K) ¥1268

一、适用範圍:

适用于快速提取各種福爾馬林固定和(hé)石蠟包埋組織DNA。

 

 

二、試劑盒組成、儲存、穩定性:

試劑盒組成

保存

50次

DE134-01

100次

DE134-02

裂解液FTL

室溫

11 ml

20 ml

結合液CB

室溫

11 ml

20 ml

抑制(zhì)物去除液IR

室溫

25 ml

50 ml

漂洗液WB

室溫

15 ml

25 ml

第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇

洗脫緩沖液EB

室溫

15 ml

15 ml

蛋白酶K粉

30mg/ml

-20℃

30mg

60mg

吸附柱DA

室溫

50個(gè)

100個(gè)

收集管CT(2ml)

室溫

50個(gè)

100個(gè)

                                    本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。

 

 

三、儲存事項:

結合液CB或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在37℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。

為(wèi)避免降低(dī)活性、方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,10mg/20mg加入0.5ml/1ml滅菌水(shuǐ)溶解,因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量分裝凍存,-20℃保存。

避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。

 

 

四、産品介紹:

福爾馬林固定或者石蠟包埋組織通(tōng)過獨特裂解液熱處理(lǐ)和(hé)蛋白酶K共同作(zuò)用迅速裂解細胞釋放出基因組DNA,然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 抑制(zhì)物去除液和(hé)漂洗液将細胞代謝物、蛋白等雜質去除, 最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。

 

五、産品特點:

① 離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用世界著名公司特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。

② 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。

③ 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在30分鍾內(nèi)完成。

④ 多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,長度可(kě)達30kb -50kb,可(kě)直接用于PCR,Southern-blot和(hé)各種酶切反應。

 

 

六、注意事項:

① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000rpm的傳統台式離心機。

② 需要自備乙醇(需要準備100%/80%/60%/40%不同濃度)或者二甲苯。

③ 實驗前将需要的水(shuǐ)浴先預熱到37℃備用。

④ 結合液CB和(hé)抑制(zhì)物去除液IR中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。

⑤ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA,不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫,但(dàn)應該确保批pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。

 

 

七、操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)

提示:第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!

1、将組織切片放入離心管子,浸泡在二甲苯中脫蠟約30分鍾(具體(tǐ)時(shí)間(jiān)根據切片厚度調整)。

2、将切片依次放入100%乙醇/80%乙醇/60%乙醇/40%乙醇/去離子水(shuǐ),每個(gè)液體(tǐ)中浸泡10秒(miǎo)鍾重新水(shuǐ)化切片。剛放入100%乙醇時(shí),應該見到切片變白。

3、顯微鏡觀察下,用刀片切下拟提取DNA的目标組織,放入預先稱重的1.5ml離心管。再次稱重,計(jì)算(suàn)出切片組織重量。

4、在25-50mg組織中加入200μl裂解液FTL,再加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立即混勻混勻後置37℃水(shuǐ)浴過夜。

5、再加入10μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),混勻後55℃水(shuǐ)浴1-2小(xiǎo)時(shí)。此步驟後,不應該出現粗大(dà)的組織顆粒。

6、加入200μl 結合液CB,立刻渦旋振蕩20秒(miǎo)充分混勻後置70℃水(shuǐ)浴10分鍾。

7、冷卻後加入100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩30秒(miǎo)充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。

8、用1毫升的槍頭吸取混合物,将混合物加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱放入收集管CT中)13,000rpm離心60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。如果有(yǒu)不溶組織物可(kě)能堵住槍頭,可(kě)将槍頭在吸水(shuǐ)紙上(shàng)輕蹭去除不溶物;如果吸上(shàng)來(lái)的混合物少(shǎo)則可(kě)以将槍頭和(hé)不溶物一起棄去,該做(zuò)法是為(wèi)了去除不溶物,以免堵塞離心柱

9、加入500μl抑制(zhì)物去除液IR,12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。

10、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

11、加入600μl漂洗液WB,12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

12、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,13,000rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。

13、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB (洗脫緩沖液事先在65-70℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好), 室溫放置3-5分鍾,12,000rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000rpm離心1分鍾。

洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于50μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。

14、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。

 

 

八、附錄:另外一種脫蠟方式

1、将目标組織切片放入離心管,加入1ml 100%二甲苯,渦旋振蕩10秒(miǎo)。瞬間(jiān)離心把組織全部浸入到二甲苯。

2、50℃水(shuǐ)浴3分鍾熔解石蠟,20-25℃最高(gāo)速離心2分鍾,收集組織到管底。

3、小(xiǎo)心用移液器(qì)吸棄上(shàng)清二甲苯,注意不要吸到沉澱。

4、加入1ml無水(shuǐ)乙醇,渦旋振蕩,最高(gāo)速離心2分鍾,小(xiǎo)心吸棄上(shàng)清乙醇。

5、加入1ml無水(shuǐ)乙醇,重複步驟4,盡可(kě)能吸棄所有(yǒu)乙醇。

6、室溫或者37℃ 晾幹乙醇10分鍾或直到所有(yǒu)乙醇揮發幹。

 

 

九、問題與解決方法:

問題

評論與建議

DNA産量低(dī)

*組織塊太大(dà),蛋白酶K消化不完全

-建議:液氮研磨或者盡量将組織切成小(xiǎo)塊,或者延長蛋白酶K消化時(shí)間(jiān)至過夜或者在原有(yǒu)消化基礎上(shàng)另加20μl蛋白酶K消化1-2小(xiǎo)時(shí)。

*蛋白酶K失效了

-建議:收到蛋白酶K後,按照每次使用量分裝凍存,避免反複凍融。

*裂解不完全或者和(hé)異丙醇沒有(yǒu)充分混勻

-建議:加入結合液後,和(hé)加入蛋白酶K後立即吹打或者渦旋混勻;加入異丙醇後立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒(miǎo)充分混勻。

組織DNA
降解了

*組織中核酸酶活性導緻降解

-建議:樣品處理(lǐ)前妥善保存在-20℃,處理(lǐ)量不要過量。

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘記加無水(shuǐ)乙醇

-建議:第一次實驗時(shí),在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇。

洗脫下來(lái)的
DNA産量低(dī)

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇

-建議:确保做(zuò)了步驟12,否則殘留乙醇會(huì)影(yǐng)響洗脫效率。

*使用了水(shuǐ)或者其它非最佳液體(tǐ)代替洗脫緩沖液

-建議:仔細閱讀仔細閱讀注意事項5和(hé)步驟13和(hé)隻使用洗脫緩沖液EB洗脫。

A260吸光值
異常偏高(gāo)

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),幹擾了吸光值

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

DNA下遊酶切
不能切開(kāi)或者
酶切不完全

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),抑制(zhì)了酶切反應

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇抑制(zhì)了酶切反應

-建議:确保做(zuò)了步驟7,然後空(kōng)氣中晾幾分鍾,讓殘留乙醇揮發。