酵母基因組DNA快速提取試劑盒(離心柱型)
DE119-01
50次
适用于快速提取各種酵母基因組DNA
規格 價格
50次(帶Lytic Enzyme,蛋白酶K) ¥820

1/适用範圍:

适用于快速提取各種酵母基因組DNA。

 

 

2/試劑盒組成、儲存、穩定性:

試劑盒組成

保存

50次DE119-01

緩沖液Y

室溫

20 ml

結合液CB

室溫

11 ml

抑制(zhì)物去除液IR

室溫

25 ml

漂洗液WB

室溫

15 ml       
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇

洗脫緩沖液EB

室溫

15 ml

Lytic Enzyme

-20℃

2.5 ml

蛋白酶K粉20mg/ml

-20℃

20mg

吸附柱DA

室溫

50個(gè)

收集管CT(2ml)

室溫

50個(gè)

                                   本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。

 

 

3/儲存事項:

① 結合液CB或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在37℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。

② 為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀(20mg),收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入1毫升滅菌水(shuǐ)溶解配制(zhì)成20mg/ml溶液,因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量分裝凍存,-20℃保存。

③ Lytic Enzyme為(wèi)蝸牛酶甘油儲液,因此比較粘稠,請(qǐng)小(xiǎo)心取用,-20℃保存。 蝸牛酶是從蝸牛的嗦囊和(hé)消化道(dào)中制(zhì)備的混合酶,它含有(yǒu)纖維素酶,果膠酶,澱粉酶,蛋白酶等20多(duō)種酶。适合破碎溶解各種酵母的細胞壁。

④ 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。

 

 

4/産品介紹:

該試劑盒采用DNA吸附柱和(hé)獨有(yǒu)的溶液系統,适合于從多(duō)種來(lái)源的酵母培養物中快速簡單地提取基因組DNA。約3ml處于指數(shù)生(shēng)長期的酵母培養液一般一次抽提可(kě)純化出10-15μg的高(gāo)質量的基因組DNA。純化DNA産物可(kě)直接用于PCR、酶切和(hé)雜交等實驗。酵母細胞經lytic Enzyme處理(lǐ)去除細胞壁後,獨特的結合液/蛋白酶K迅速裂解細胞和(hé)滅活細胞內(nèi)核酸酶,然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 抑制(zhì)物去除液和(hé)漂洗液将細胞代謝物,蛋白等雜質去除, 最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。

 

 

5/産品特點:

① 離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用世界著名公司特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。

② 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。

③ 快速,簡捷,單個(gè)樣品裂解後操作(zuò)一般可(kě)在30分鍾內(nèi)完成。

④ 多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,可(kě)直接用于PCR,Southern-blot和(hé)各種酶切反應。

 

 

6/注意事項:

① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000rpm的傳統台式離心機。

② 需要自備乙醇、異丙醇、 β-巯基乙醇。

③ 開(kāi)始實驗前将需要的水(shuǐ)浴先預熱到37℃和(hé)70℃備用。

④ 結合液CB 和(hé)抑制(zhì)物去除液IR中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。

⑤ 用戶需要自備Sorbitol buffer( 1M 山(shān)梨醇 0.1M Na2EDTA,14 mMβ-巯基乙醇)配制(zhì)方法:在600 ml 去離子水(shuǐ)裏面溶解 182.2克山(shān)梨醇,加入200 ml 0.5 M Na2EDTA (pH 8.0) ,不需要調節PH值,定容到1L,4℃保存。臨用前加0.2%β-巯基乙醇(商品化的β-巯基乙醇摩爾濃度一般為(wèi)14M)

⑥ 菌體(tǐ)濃度檢測一般OD260值為(wèi)1的時(shí)候,釀酒酵母細胞是1-2x107 cells/ml,由于菌種和(hé)分光度計(jì)不同即使同樣細胞數(shù)量OD值變化也很(hěn)大(dà),以上(shàng)僅供參考。

⑦ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA,不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫,但(dàn)應該确保批pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。

 

 

7/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)

提示:● 第一次使用前請(qǐng)先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!

  1.  ● 吸取使用量的Sorbitol buffer加入0.2%β-巯基乙醇,回複到室溫備用。
  2.  
  3. 1、取1-3毫升酵母培養物(不超過3X107 cells,最好是早對數(shù)生(shēng)長期),12,000rpm離心30秒(miǎo),盡可(kě)能的吸棄上(shàng)清,收集菌體(tǐ)。收集超過1.5毫升菌液,可(kě)以離心棄上(shàng)清後,在同一個(gè)1.5ml管內(nèi)加入更多(duō)的菌液,重複步驟1,直到收集到足夠的菌體(tǐ)。
  4. 2、加入300μl Sorbitol buffer,輕柔吹打充分重懸細胞;再加入50μl Lytic Enzyme儲液,充分颠倒混勻,37℃溫育1-3小(xiǎo)時(shí)消化細胞壁,中間(jiān)可(kě)颠倒數(shù)次幫助消化。如果破壁效果不好導緻産量低(dī),可(kě)以加大(dà)Lytic Enzyme 用量來(lái)提高(gāo)酶工作(zuò)濃度,還(hái)可(kě)以延長消化時(shí)間(jiān)或者提高(gāo)溫度到45來(lái)提高(gāo)效果,不适合Lytic Enzyme消化的酵母可(kě)選用其它方法如0.5mm玻璃珠渦旋擊打 ,反複凍融等。玻璃珠法:向菌體(tǐ)中加入180μl 緩沖液Y徹底懸浮菌體(tǐ),加入0.1g直徑為(wèi)0.45-0.55mm的酸洗玻璃珠,渦旋振蕩10分鍾,靜置幾分鍾讓玻璃珠沉澱,小(xiǎo)心吸取上(shàng)清到一個(gè)新管後接後續步驟4
  5. 3、13,000rpm離心1分鍾,盡可(kě)能吸棄上(shàng)清,加180μl 緩沖液Y充分重懸細胞團。
  6. 4、加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。
  7. 5、将混合物放置在55℃水(shuǐ)浴消化直到消化完全,期間(jiān)輕柔的振蕩幾次幫助裂解。所需消化時(shí)間(jiān)和(hé)酵母數(shù)量、種類和(hé)生(shēng)長狀态有(yǒu)關,一般15分鍾即可(kě),但(dàn)是如果方便的話(huà)消化過夜也無不良影(yǐng)響。可(kě)選步驟,一般不需要: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)在完成操作(zuò)步驟5後加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。
  8. 6、加入200μl結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,70℃放置10分鍾。
  9. 7、冷卻後加入100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。
  10. 8、将上(shàng)一步混合物(包括可(kě)能有(yǒu)的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000rpm離心30-60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。
  11. 9、加入500μl抑制(zhì)物去除液IR,12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。
  12. 10、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
  13. 11、加入600μl漂洗液WB,12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。
  14. 12、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,13,000rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。
  15. 13、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好), 室溫放置3-5分鍾,12,000rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000rpm離心1分鍾。洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于50μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。
  16. 14、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。

 

 

8/問題與解決方法:

問題

評論與建議

DNA産量低(dī)

*某些(xiē)種類酵母裂解困難

-建議:仔細閱讀步驟2,确認處理(lǐ)的酵母種類可(kě)以用Lytic Enzyme裂解,還(hái)可(kě)以考慮選用其它裂解方法如玻璃珠渦旋擊打、煮沸、反複凍融等,使用早對數(shù)生(shēng)長期酵母。

*蛋白酶K失效了

-建議:按照每次使用量分裝凍存,避免反複凍融,延長處理(lǐ)時(shí)間(jiān)。

*裂解不完全或者和(hé)異丙醇沒有(yǒu)充分混勻

-建議:加入結合液後,和(hé)加入蛋白酶K後立即吹打或者渦旋混勻;加入異丙醇後立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒(miǎo)充分混勻。

DNA降解

*組織中核酸酶活性導緻降解

-建議樣品處理(lǐ)前妥善保存在-20℃,處理(lǐ)量不要過量。

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘記加無水(shuǐ)乙醇

-建議:第一次實驗時(shí),在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇。

洗脫下來(lái)的
DNA産量低(dī)

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇

-建議:确保做(zuò)了步驟12,否則殘留乙醇會(huì)影(yǐng)響洗脫效率。

*使用了水(shuǐ)或者其它非最佳液體(tǐ)代替洗脫緩沖液

-建議:仔細閱讀注意事項7和(hé)步驟13和(hé)隻使用洗脫緩沖液EB洗脫。

A260吸光值
異常偏高(gāo)

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),幹擾了吸光值

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

DNA下遊酶切
不能切開(kāi)或者
酶切不完全

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),抑制(zhì)了酶切反應

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇抑制(zhì)了酶切反應

-建議:确保做(zuò)了步驟12,然後空(kōng)氣中晾幾分鍾,讓殘留乙醇揮發。