SoilPure 超純土壤基因組DNA快速提取試劑盒
DE127-01
50次
适用于快速提取各種土壤基因組DNA
規格 價格
50次(帶蛋白酶K) ¥1680

一、适用範圍:

适用于快速提取各種土壤基因組DNA。

 

 

二、試劑盒組成、儲存、穩定性:

試劑盒組成

保存

50DE127-01

溶液S

室溫

25 ml

溶液L

室溫

6 ml

溶液A

室溫

15 ml

溶液B

室溫

15 ml

溶液C

室溫

30 ml第一次使用前,請(qǐng)加2倍體(tǐ)積無水(shuǐ)乙醇

抑制(zhì)物去除液IR

室溫

25 ml

漂洗液WB

室溫

15ml第一次使用前,請(qǐng)加60ml無水(shuǐ)乙醇

洗脫緩沖液EB

室溫

10 ml

蛋白酶K粉

20mg/ml

-20℃

20mg

吸附柱DA和(hé)收集管CT

室溫

50套

                                      本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。

 

 

三、儲存事項:

① 溶液L或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在37℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用,注意不要劇(jù)烈搖晃,以免産生(shēng)大(dà)量氣泡。

② 為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入1ml滅菌水(shuǐ)溶解,因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量( 20μl )分裝凍存,-20℃保存。

③ 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。

 

 

四、産品介紹:

普通(tōng)的手提或者試劑盒提取的土壤基因組DNA由于常常殘留有(yǒu)PCR的強烈抑制(zhì)物如腐殖酸、棕黃酸等雜質造成實驗失敗,此外,由于采用了劇(jù)烈的玻璃珠擊打來(lái)破裂菌體(tǐ),常常造成DNA剪切和(hé)降解。本公司經過長期研發開(kāi)發出了具有(yǒu)自主知識産權的土壤基因組DNA,通(tōng)過專利配方的腐殖酸和(hé)棕黃酸去除試劑配合特殊處理(lǐ)的純化柱,可(kě)以最大(dà)程度的去除這些(xiē)雜質,同時(shí)加上(shàng)多(duō)次柱漂洗,确保得(de)到的DNA具有(yǒu)極高(gāo)純度,此外獨特的抽提和(hé)裂解體(tǐ)系可(kě)以迅速裂解細胞(壁)和(hé)滅活細胞內(nèi)核酸酶,不需要借助玻璃珠破壁,有(yǒu)效保證了基因組DNA的完整性。

 

 

五、産品特點:

① 本公司獨有(yǒu)的專利配方和(hé)純化柱能有(yǒu)效去除腐殖酸等雜質。

② 不需要借助玻璃珠破壁,有(yǒu)效保證了基因組DNA的完整性,長度可(kě)達30kb -50kb,可(kě)直接用于PCR,Southern-blot和(hé)各種酶切反應。

③ 兼容性強,适用于各種不同的土壤包括淤泥等提取困難的土壤。

④ 多(duō)步驟去除各種雜質和(hé)抑制(zhì)物,保證極高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9。

⑤ 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。

⑥ 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在60分鍾內(nèi)完成。

 

 

六、注意事項:

① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000rpm的傳統台式離心機。

② 開(kāi)始實驗前根據需要将水(shuǐ)浴預熱到37℃或者70℃備用。

③ 溶液C和(hé)抑制(zhì)物去除液IR中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。

④ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA,不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫,但(dàn)應該确保批pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。

 

 

七、操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)

提示:第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB和(hé)溶液C中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!

1、 取0.2g 土壤放入離心管,用牙簽或者槍頭搗碎後加入0.5ml溶液S,用槍頭攪拌後短(duǎn)暫渦旋幫助重懸。如果預計(jì)土壤裏面含有(yǒu)較多(duō)難裂解的菌類如革蘭氏陽性菌,可(kě)先在0.5ml溶液S裏面加入10mg的溶菌酶,吹打混勻後再加入,并加做(zuò)步驟2。

2、(可(kě)選步驟):37℃溫育30分鍾,每10分鍾颠倒混勻幾次。對于難裂解的菌類如革蘭氏陽性菌含量豐富的土壤,并在上(shàng)一步驟加入了溶菌酶的樣品,需要加做(zuò)此步驟來(lái)幫助裂解。 

3、加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,短(duǎn)暫渦旋幫助混勻。可(kě)選做(zuò)步驟: 為(wèi)提高(gāo)産量,可(kě)以在37℃振蕩10分鍾或者渦旋振蕩2分鍾。(注意渦旋振蕩可(kě)能剪切DNA)

4、加入120μl 溶液L,短(duǎn)暫渦旋混勻,65℃溫育30分鍾,期間(jiān)颠倒混勻幾次。65℃溫育時(shí)間(jiān)可(kě)以根據具體(tǐ)樣品種類和(hé)産量進行(xíng)延長或者縮短(duǎn)以取得(de)最佳産量和(hé)純度,可(kě)在10分鍾-2小(xiǎo)時(shí)範圍內(nèi)調整。

5、(可(kě)選步驟):70℃冷凍,65℃融化,反複3次。對于難裂解的菌類如革蘭氏陽性菌含量豐富的土壤, 可(kě)加做(zuò)此步驟來(lái)幫助裂解。 

6、颠倒混勻後,13,000 rpm離心2分鍾,小(xiǎo)心轉移上(shàng)清至新的離心管(記錄上(shàng)清體(tǐ)積)。

7、加入1/3(三分之一)體(tǐ)積的溶液A,颠倒幾次,渦旋5秒(miǎo)混勻後,冰上(shàng)放置5分鍾。

8、13,000 rpm離心5分鍾,小(xiǎo)心轉移上(shàng)清至新的離心管(記錄上(shàng)清體(tǐ)積)。

9、加入1/3(三分之一)體(tǐ)積的溶液B,颠倒幾次,短(duǎn)暫渦旋混勻後,冰上(shàng)放置5分鍾。該步驟主要是進一步去除humic substance等PCR抑制(zhì)物質以提高(gāo)純度,但(dàn)是會(huì)降低(dī)一些(xiē)産量,如果對産量要求高(gāo)或者提取的DNA不用于PCR,可(kě)以嘗試略去此步驟以提高(gāo)産量。如果預計(jì)土壤成份複雜PCR抑制(zhì)物質多(duō),可(kě)以适當提高(gāo)溶液B加入量(如加入等體(tǐ)積的溶液B),可(kě)以提高(gāo)純度,但(dàn)是注意也會(huì)顯著降低(dī)産量。

10、13,000 rpm離心5分鍾,小(xiǎo)心轉移上(shàng)清至新的離心管(記錄上(shàng)清體(tǐ)積)。

11、加入1.5倍體(tǐ)積的溶液C請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!,颠倒幾次,短(duǎn)暫渦旋混勻。

12、将上(shàng)一步混合物700μl(包括可(kě)能有(yǒu)的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱放入收集管CT中),12,000rpm離心30-60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。重複直到所有(yǒu)的混合物都加完。

13、加入500μl抑制(zhì)物去除液IR,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。

14、加入600μl漂洗液WB請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

15、加入600μl漂洗液WB,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

16、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。

17、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好), 室溫放置3-5分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000 rpm離心1分鍾。洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于50μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。

18、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。