小(xiǎo)量全血基因組DNA快速提取試劑盒(離心柱型)
DE102
50次、100次、200次
适用于快速提取全血基因組DNA
規格 價格
50次(帶蛋白酶K) ¥588
100次(帶蛋白酶K) ¥1020
200次(帶蛋白酶K) ¥1960

1/适用範圍:

适用于快速提取全血基因組DNA。 

 

 

2/試劑盒組成、儲存、穩定性:

試劑盒組成

保存

DE102-01

50次

DE102-02

100次

DE102-03

200次

平衡液BS

室溫

5 ml

10 ml

20 ml

緩沖液BB

室溫

10 ml

20 ml

40 ml

結合液CB

室溫

15 ml

30 ml

60 ml

抑制(zhì)物去除液IR

室溫

25 ml

50 ml

100 ml

漂洗液WB

室溫

   15 ml                         25 ml                       50 ml
           第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇

洗脫緩沖液EB

室溫

15 ml

15 ml

15 ml x 2

蛋白酶K粉
20mg/ml

-20℃

20mg

20mg×2

20mg×4

吸附柱DA

室溫

50個(gè)

100個(gè)

200個(gè)

收集管(2ml)

室溫

50個(gè)

100個(gè)

200個(gè)

本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。

 

 

3/儲存事項:

① 結合液CB或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在37℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。

② 為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入1毫升滅菌水(shuǐ)溶解。因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量分裝凍存,-20℃保存。

③ 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中發生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。

 

 

4/産品介紹:

獨特的結合液/蛋白酶K迅速裂解細胞和(hé)滅活細胞內(nèi)核酸酶,然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 抑制(zhì)物去除液和(hé)漂洗液将細胞代謝物、蛋白等雜質去除,最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。

 

 

5/産品特點:

① 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。

② 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在20分鍾內(nèi)完成。

③ 多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,典型的産量200µl全血可(kě)提取出3-12µg,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,長度可(kě)達30 kb -50kb,可(kě)直接用于PCR、Southern-blot和(hé)各種酶切反應。

④ 從十幾個(gè)配方中優選出的紅細胞裂解液配方,裂解快速完全,客戶可(kě)根據需要選擇購買。

⑤ 典型的産量200µl全血可(kě)提取出3-12µg 基因組DNA。

 

 

6/注意事項:

① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000 rpm的傳統台式離心機。

② 不同樣品尤其疾病樣品中白細胞數(shù)量差異可(kě)能非常大(dà),因此産量的個(gè)體(tǐ)差異也可(kě)能非常大(dà)。

③ 需要自備異丙醇。

④ 開(kāi)始實驗前将需要的水(shuǐ)浴先預熱到70℃備用。

⑤ 為(wèi)了最佳效果,最好使用新鮮血液标本或者4℃存放少(shǎo)于3天的标本,不要使用反複凍融超過3次的标本,否則會(huì)嚴重降低(dī)産量。

⑥ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA,不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫,但(dàn)應該确保批pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。

 

 

7/關于平衡液BS的使用

● 介紹:核酸吸附矽膠膜柱子長期放置過程中會(huì)同空(kōng)氣中的電(diàn)荷/塵埃發生(shēng)反應而影(yǐng)響其核酸的結合能力。矽膠柱經平衡液BS預處理(lǐ)後可(kě)大(dà)大(dà)減少(shǎo)柱子中矽膠膜的憎水(shuǐ)基團,提高(gāo)核酸的結合能力。從而提高(gāo)矽膠柱子回收效率或者産量。平衡液BS是強堿性溶液,若不小(xiǎo)心碰到,請(qǐng)用大(dà)量自來(lái)水(shuǐ)清洗。用完後需蓋緊瓶蓋,以免接觸空(kōng)氣。室溫保存。在保存過程中可(kě)能有(yǒu)沉澱生(shēng)成,請(qǐng)加熱至37℃使沉澱完全消失。

● 使用方法:取一個(gè)新的矽膠膜吸附柱子裝在收集管中,吸取100μl的平衡液BS至柱子中。13000 rpm離心1分鍾,倒掉收集管中廢液,将吸附柱子重新放回收集管。此時(shí)平衡液BS預處理(lǐ)柱子完畢。接後續的操作(zuò)步驟。

 

 

8/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)

提示:第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!

1、取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液,放入1.5ml離心管。

如果全血起始量小(xiǎo)于200μl,則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間(jiān),則後續操作(zuò)需要按照比例增加試劑用量。如果起始量介于300μl-1ml之間(jiān),則需要先進行(xíng)紅細胞裂解操作(zuò)(見本說明(míng)書(shū)後附錄)。

如果處理(lǐ)血樣為(wèi)禽類、鳥類、兩栖類或更低(dī)級生(shēng)物的抗凝血液,其紅細胞為(wèi)有(yǒu)核細胞,因此處理(lǐ)量5-20μl,可(kě)加緩沖液BB補足到200μl後進行(xíng)後續步驟。

2、加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,再加入200μl結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在70℃放置10分鍾。溶液應變清亮(但(dàn)顔色偏黑(hēi)色)。

可(kě)選步驟,一般不需要: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)以加入200μl 結合液CB 加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。

平衡液BS預處理(lǐ)吸附柱備用:

使用平衡液BS預處理(lǐ)矽膠膜吸附柱為(wèi)必做(zuò)步驟,具體(tǐ)方法參見前文“關于平衡液BS的使用”

3、冷卻後加入100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。

上(shàng)述步驟中立刻渦旋或者吹打充分混勻非常重要,混勻不充分嚴重降低(dī)産量,必要時(shí)如樣品粘稠不易混勻時(shí)可(kě)以渦旋振蕩15秒(miǎo)混勻。

4、将上(shàng)一步混合物(包括可(kě)能有(yǒu)的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管中)13,000 rpm離心30-60秒(miǎo),倒掉收集管中的廢液。

5、加入500μl抑制(zhì)物去除液IR,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。

6、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

7、加入600μl漂洗液WB,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

8、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。

9、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好), 室溫放置3-5分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000 rpm離心1分鍾。

洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于50μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。

10、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。

 

 

9/附錄(以300μl,1ml全血舉例紅細胞裂解操作(zuò)):

1、吸取900μl紅細胞裂解液到一個(gè)1.5ml離心管或者3ml紅細胞裂解液到一個(gè)15ml離心管。(紅細胞裂解液可(kě)向本公司購買)

2、将抗凝全血(使用前回複到室溫)颠倒混勻後,吸取300μl全血和(hé)1ml全血分别加到上(shàng)述1.5ml和(hé)15ml離心管中,颠倒6-8次,并倒置輕彈管壁,确保充分混勻。

3、室溫放置10分鍾(期間(jiān)應該颠倒輕彈混勻數(shù)次,幫助裂解紅細胞)。

4、12,000 rpm離心20秒(miǎo)(對于1.5ml離心管)或2,000-3,000 rpm離心5分鍾(對于15ml離心管),倒棄紅色上(shàng)清,并小(xiǎo)心的盡可(kě)能多(duō)的吸棄上(shàng)清(注意不要吸到管底的細胞團),留下完整的管底白細胞團和(hé)大(dà)約10μl的殘留上(shàng)清。

離心後在管底應該見到白色的白細胞團,也可(kě)能有(yǒu)一些(xiē)紅細胞殘片和(hé)白細胞團在一起,但(dàn)是如果看到的是大(dà)部分的紅色細胞團,說明(míng)紅細胞裂解很(hěn)不充分,應該再加入紅細胞裂解液重懸細胞團後重複步驟3,4。

5、加入200μl緩沖液BB渦旋振蕩重懸白細胞團,充分分散白細胞團。

其中由于肝素抗凝血的白細胞沉澱團很(hěn)難打散重懸,影(yǐng)響後續實驗裂解效果,建議選用非肝素的抗凝劑收集血液标本。

6、現在可(kě)以按照操作(zuò)步驟提取全血基因組DNA了。

 

 

10/問題與解決方案

 

問題

評論與建議

标本中
含有(yǒu)血凝塊

*不恰當的存放标本,未充分混勻,未使用合适的抗凝劑

-建議:丢棄有(yǒu)血凝塊的标本,重新用EDTA,肝素,檸檬酸劑收集血液。

紅細胞裂解
不完全

*血液标本裂解前沒有(yǒu)回複到室溫

-建議:處理(lǐ)前先把血液标本回複到室溫。

*裂解時(shí)間(jiān)不夠

-建議:可(kě)延長裂解時(shí)間(jiān)至15分鍾以上(shàng)。

*裂解過程中沒有(yǒu)混勻

-建議:裂解過程中可(kě)以更多(duō)次颠倒混勻,或者輕彈管壁幫助裂解。

DNA産量低(dī)

*血液标本中本身含有(yǒu)的白細胞數(shù)量低(dī)

-建議:增加起始血液處理(lǐ)量。

*血液标本存放時(shí)間(jiān)太長

-建議:存放在4℃的血液标本超過5天的産量可(kě)能大(dà)大(dà)降低(dī),因此不要存放太久。

*蛋白酶K失效了

-建議:收到蛋白酶K後,按照每次使用量分裝凍存,避免反複凍融。

*裂解不完全或者和(hé)異丙醇沒有(yǒu)充分混勻

-建議:加入結合液後,和(hé)加入蛋白酶K後立即吹打或者渦旋混勻;加入異丙醇後立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒(miǎo)充分混勻。

*洗脫效率不高(gāo)

-建議:确保做(zuò)了步驟8,否則殘留乙醇會(huì)影(yǐng)響洗脫效率,仔細閱讀仔細閱讀注意事項6和(hé)步驟9和(hé)隻使用洗脫緩沖液EB洗脫。

DNA下遊酶切
不能切開(kāi)或者
酶切不完全

*忘記做(zuò)步驟8,乙醇抑制(zhì)了酶切反應

-建議:做(zuò)步驟8,然後空(kōng)氣中晾幾分鍾,讓殘留乙醇揮發。

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),抑制(zhì)了酶切反應

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。 

DNA長度
小(xiǎo)于15kb

*血液樣品太老或者不正确的存放,造成DNA降解

-建議:選用新鮮的血液樣品

*操作(zuò)不當,造成對基因組DNA的剪切

-建議:混勻時(shí)不可(kě)太劇(jù)烈,不可(kě)以用手劇(jù)烈振蕩離心管,選用大(dà)口徑的槍頭轉移或者混勻DNA。

A260吸光值
異常偏高(gāo)

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),幹擾了吸光值

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

洗脫下來(lái)的
DNA溶液還(hái)帶有(yǒu)輕微的顔色

*漂洗不完全

-建議:1. 漂洗,直到離心下來(lái)的液體(tǐ)沒有(yǒu)顔色;2. 将洗脫液當成起始材料,再重複一遍實驗,注意略去蛋白酶K消化和(hé)70℃孵育步驟。