全血/組織/細胞基因組DNA快速提取試劑盒
DE111
50次、100次、200次
适用于快速提取全血、各種動植物組織細胞基因組DNA
規格 價格
50次(帶蛋白酶K) ¥630
100次(帶蛋白酶K) ¥1120
200次(帶蛋白酶K) ¥2100

1/适用範圍:

适用于快速提取全血、各種動植物組織細胞基因組DNA。 

 

 

2/試劑盒組成、儲存、穩定性:

試劑盒組成

保存

50次

DE111-01

100次

DE111-02

平衡液BS

室溫

5 ml

10 ml

裂解液TL

室溫

11 ml

20 ml

緩沖液BB

室溫

10 ml

20 ml

結合液CB

室溫

15 ml

30 ml

抑制(zhì)物去除液IR

室溫

25 ml

50 ml

漂洗液WB

室溫

15 ml            25 ml      
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇

洗脫緩沖液EB

室溫

15 ml

15 ml

蛋白酶K粉
20mg/ml

-20℃

20mg

40mg

吸附柱DA

室溫

50個(gè)

100個(gè)

收集管CT(2ml)

室溫

50個(gè)

100個(gè)

本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。

 

 

3/儲存事項:

① 裂解液TL、結合液CB、或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在37℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。

② 為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入1毫升滅菌水(shuǐ)溶解。因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量(20微升)分裝凍存,-20℃保存。

③ 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中發生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。

 

 

4/産品介紹:

獨特的結合液/蛋白酶K迅速裂解細胞和(hé)滅活細胞內(nèi)核酸酶,然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的, 抑制(zhì)物去除液和(hé)漂洗液将細胞代謝物、蛋白等雜質去除,最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。

 

 

5/産品特點:

① 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等。

② 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在30分鍾內(nèi)完成。

③ 多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,典型的産量200µl全血可(kě)提取出3-6µg,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,長度可(kě)達30 kb -50kb,可(kě)直接用于PCR、Southern-blot和(hé)各種酶切反應。

④ 從十幾個(gè)配方中優選出的紅細胞裂解液配方,裂解快速完全,客戶可(kě)根據需要選擇購買。

⑤ 典型的産量200µl全血可(kě)提取出3-6µg 基因組DNA。

 

 

6/注意事項:

① 所有(yǒu)的離心均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000 rpm的傳統台式離心機。

② 需要自備1XPBS(磷酸鹽緩沖液)和(hé)異丙醇。

③ 不同樣品尤其疾病樣品中白細胞數(shù)量差異可(kě)能非常大(dà),因此産量的個(gè)體(tǐ)差異也可(kě)能非常大(dà)。

④ 開(kāi)始實驗前将需要的水(shuǐ)浴先預熱到70℃備用。

⑤ 為(wèi)了最佳效果,最好使用新鮮血液标本或者4℃存放少(shǎo)于3天的标本,不要使用反複凍融超過3次的标本,否則會(huì)嚴重降低(dī)産量。

 

 

7/關于平衡液BS的使用

介紹:核酸吸附矽膠膜柱子長期放置過程中會(huì)同空(kōng)氣中的電(diàn)荷/塵埃發生(shēng)反應而影(yǐng)響其核酸的結合能力。矽膠柱經平衡液BS預處理(lǐ)後可(kě)大(dà)大(dà)減少(shǎo)柱子中矽膠膜的憎水(shuǐ)基團,提高(gāo)核酸的結合能力。從而提高(gāo)矽膠柱子回收效率或者産量。平衡液BS是強堿性溶液,若不小(xiǎo)心碰到,請(qǐng)用大(dà)量自來(lái)水(shuǐ)清洗。用完後需蓋緊瓶蓋,以免接觸空(kōng)氣。室溫保存。在保存過程中可(kě)能有(yǒu)沉澱生(shēng)成,請(qǐng)加熱至37℃使沉澱完全消失。

使用方法:(臨用前才預處理(lǐ))取一個(gè)新的矽膠膜吸附柱裝在收集管CT中,吸取100μl的平衡液BS至柱子中。13000 rpm離心1分鍾,倒掉收集管CT中廢液,将吸附柱子重新放回收集管CT。此時(shí)平衡液BS預處理(lǐ)柱子完畢。接後續的操作(zuò)步驟。

 

 

8/操作(zuò)步驟:(實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)

提示:第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!

平衡液BS預處理(lǐ)吸附柱備用:

使用平衡液BS預處理(lǐ)矽膠膜吸附柱為(wèi)必做(zuò)步驟,具體(tǐ)方法參見前文“關于平衡液BS的使用”

 

1、全血

a、取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液,放入1.5ml離心管。

如果全血起始量小(xiǎo)于200μl,則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間(jiān),則後續操作(zuò)需要按照比例增加試劑用量。如果起始量介于300μl-1ml之間(jiān),則需要先進行(xíng)紅細胞裂解操作(zuò)(見本說明(míng)書(shū)後附錄)。

如果處理(lǐ)血樣為(wèi)禽類、鳥類、兩栖類或更低(dī)級生(shēng)物的抗凝血液,其紅細胞為(wèi)有(yǒu)核細胞,因此處理(lǐ)量5-20μl,可(kě)加緩沖液BB補足到200μl後進行(xíng)後續步驟。

b、加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,再加入200μl結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在70℃放置10分鍾。溶液應變清亮(但(dàn)顔色偏黑(hēi)色)。

可(kě)選步驟,一般不需要: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)以加入200μl 結合液CB 加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。

c、冷卻後加100μl異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。

上(shàng)述步驟中立刻渦旋或者吹打充分混勻非常重要,混勻不充分嚴重降低(dī)産量,必要時(shí)如樣品粘稠不易混勻時(shí)可(kě)以渦旋振蕩15秒(miǎo)混勻。

d、将上(shàng)一步所得(de)溶液和(hé)絮狀沉澱都加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000 rpm離心60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。

e、接操作(zuò)步驟項下5。

 

2、組織培養細胞

a、收集約105-106懸浮細胞到一個(gè)1.5ml離心管;對于貼壁細胞,應該先用胰蛋白酶消化後吹打下來(lái)收集。

b、13,000rpm離心10秒(miǎo),使細胞沉澱下來(lái)。棄上(shàng)清,留下細胞團和(hé)大(dà)約10-20μl殘留的液體(tǐ)。

c、加200μl 1XPBS重懸洗滌細胞,13,000rpm離心10秒(miǎo),使細胞沉澱下來(lái)。完全吸棄上(shàng)清, 将細胞沉澱重懸于180μl 1XPBS中。

d、加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,再加入200μl結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在70℃放置10分鍾。

可(kě)選做(zuò)步驟: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)以加入200μl 結合液CB 加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。

e、冷卻後加100μl異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。

f、将上(shàng)一步混合物(包括可(kě)能有(yǒu)的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000rpm離心60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。

g、接操作(zuò)步驟項下5。

 

 

 

3、動植物組織(例如鼠肝腦(nǎo)或者植物葉片)

a、将20-50mg新鮮或者解凍的組織用解剖刀切成小(xiǎo)碎塊(切成小(xiǎo)塊可(kě)以提高(gāo)産量)或者在液氮中研磨組織成細粉後,轉入裝有(yǒu)180μl組織裂解液TL的1.5ml離心管中, 用大(dà)口徑槍頭吹打混勻。

b、加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻

c、将裂解物放置在55℃水(shuǐ)浴1-3小(xiǎo)時(shí)或者直到組織消化完全,期間(jiān)輕柔的振蕩幾次幫助裂解。

可(kě)選做(zuò)步驟: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)在完成步驟c後加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。

d、加入200μl 結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,70℃放置10分鍾。

e、冷卻後加100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。

f、用1ml的槍頭吸取混合物,将混合物加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000rpm離心60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。

如果有(yǒu)不溶組織物可(kě)能堵住槍頭,可(kě)将槍頭在吸水(shuǐ)紙上(shàng)輕蹭去除不溶物;如果吸上(shàng)來(lái)的混合物少(shǎo)則可(kě)以将槍頭和(hé)不溶物一起棄去,該做(zuò)法是為(wèi)了去除不溶物,以免堵塞離心柱

g、接操作(zuò)步驟項下5。

 

 

4、動物組織(鼠尾)

a、将0.2-0.5cm的鼠尾巴尖(即20-50mg)剪碎(一定要剪0-2cm範圍內(nèi)的尾巴尖,否則裂解效果不好),或者在液氮中研磨組織成細粉後,轉入裝有(yǒu)180μl組織裂解液TL的1.5ml離心管中, 用大(dà)口徑槍頭吹打混勻。

b、加入20μl的蛋白酶K(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻

c、将裂解物放置在55℃水(shuǐ)浴3小(xiǎo)時(shí)或者直到組織消化完全,期間(jiān)輕柔的振蕩幾次幫助裂解。

可(kě)選做(zuò)步驟: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)在完成步驟c後加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。

d、用一個(gè)1ml不帶針頭的一次性輸液器(qì)抽打裂解物2-3次。

e、加入200μl 結合液CB和(hé)100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻

f、13,000rpm 離心5分鍾,将上(shàng)清加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000rpm離心30-60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。

g、接操作(zuò)步驟項下5。

 

上(shàng)述步驟中立刻渦旋或者吹打充分混勻非常重要,混勻不充分嚴重降低(dī)産量,必要時(shí)如樣品粘稠不易混勻時(shí)可(kě)以渦旋振蕩15秒(miǎo)混勻。

5、加入500μl抑制(zhì)物去除液IR,12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。

6、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

7、加入600μl漂洗液WB,12,000rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

8、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,13,000rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。

9、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB (洗脫緩沖液事先在65-70℃水(shuǐ)浴中預熱), 室溫放置3-5分鍾,12,000rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000rpm離心1分鍾。

洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于50μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。

10、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。

 

 

9/附錄(以300μl,1ml全血舉例紅細胞裂解操作(zuò)):

1、吸取900μl紅細胞裂解液到一個(gè)1.5ml離心管或者3ml紅細胞裂解液到一個(gè)15ml離心管。(紅細胞裂解液可(kě)向本公司購買)

2、将抗凝全血(使用前回複到室溫)颠倒混勻後,吸取300μl全血和(hé)1ml全血分别加到上(shàng)述1.5ml和(hé)15ml離心管中,颠倒6-8次,并倒置輕彈管壁,确保充分混勻。

3、室溫放置10分鍾(期間(jiān)應該颠倒輕彈混勻數(shù)次,幫助裂解紅細胞)。

4、12,000 rpm離心20秒(miǎo)(對于1.5ml離心管)或2,000-3,000 rpm離心5分鍾(對于15ml離心管),倒棄紅色上(shàng)清,并小(xiǎo)心的盡可(kě)能多(duō)的吸棄上(shàng)清(注意不要吸到管底的細胞團),留下完整的管底白細胞團和(hé)大(dà)約10μl的殘留上(shàng)清。

離心後在管底應該見到白色的白細胞團,也可(kě)能有(yǒu)一些(xiē)紅細胞殘片和(hé)白細胞團在一起,但(dàn)是如果看到的是大(dà)部分的紅色細胞團,說明(míng)紅細胞裂解很(hěn)不充分,應該再加入紅細胞裂解液重懸細胞團後重複3,4。

5、加入200μl緩沖液BB渦旋振蕩重懸白細胞團,充分分散白細胞團。

其中由于肝素抗凝血的白細胞沉澱團很(hěn)難打散重懸,影(yǐng)響後續實驗裂解效果,建議選用非肝素的抗凝劑收集血液标本。

6、現在可(kě)以按照操作(zuò)提取全血基因組DNA了。

 

 

10/問題與解決方法

問題

評論與建議

DNA産量低(dī)

*組織塊太大(dà),蛋白酶K消化不完全

-建議:液氮研磨或者盡量将組織切成小(xiǎo)塊,或者延長蛋白酶K消化時(shí)間(jiān)至過夜或者在原有(yǒu)消化基礎上(shàng)另加20μl蛋白酶K消化1-2小(xiǎo)時(shí)。

*蛋白酶K失效了

-建議:收到蛋白酶K後,按照每次使用量分裝凍存,避免反複凍融。

*裂解不完全或者和(hé)異丙醇沒有(yǒu)充分混勻

-建議:加入結合液後,和(hé)加入蛋白酶K後立即吹打或者渦旋混勻;加入異丙醇後立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒(miǎo)充分混勻。

組織DNA
降解了

*組織中核酸酶活性導緻降解

-建議:樣品處理(lǐ)前妥善保存在-20℃,處理(lǐ)量不要過量。

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘記加無水(shuǐ)乙醇

-建議:第一次實驗時(shí),在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇。

洗脫下來(lái)的
DNA産量低(dī)

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇

-建議:确保做(zuò)了步驟7,否則殘留乙醇會(huì)影(yǐng)響洗脫效率。

*使用了水(shuǐ)或者其它非最佳液體(tǐ)代替洗脫緩沖液

-建議:仔細閱讀仔細閱讀注意事項5和(hé)步驟8和(hé)隻使用洗脫緩沖液EB洗脫。

A260吸光值
異常偏高(gāo)

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),幹擾了吸光值

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

DNA下遊酶切
不能切開(kāi)或者
酶切不完全

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),抑制(zhì)了酶切反應

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇抑制(zhì)了酶切反應

-建議:确保做(zuò)了步驟7,然後空(kōng)氣中晾幾分鍾,讓殘留乙醇揮發。