細菌基因組DNA快速提取試劑盒
DE112
50次、100次、200次
适用于快速提取各種細菌基因組DNA
規格 價格
50次(帶蛋白酶K) ¥588
100次(帶蛋白酶K) ¥1086
200次(帶蛋白酶K) ¥1900

1/适用範圍:

适用于快速提取各種細菌基因組DNA。

 

 

2/試劑盒組成、儲存、穩定性:

試劑盒組成

保存

50

DE112-01

100

DE112-02

緩沖液RB

室溫

30 ml

60ml

結合液CB

室溫

11 ml

20 ml

抑制(zhì)物去除液IR

室溫

25 ml

50 ml

漂洗液WB

室溫

15 ml             25 ml     
第一次使用前按說明(míng)加指定量乙醇

洗脫緩沖液EB

室溫

15 ml

20 ml

蛋白酶K粉

20mg/ml

-20℃

20mg

2×20mg

吸附柱DA

室溫

50個(gè)

100個(gè)

收集管CT(2ml)

室溫

50個(gè)

100個(gè)

本試劑盒在室溫儲存12個(gè)月不影(yǐng)響使用效果。

 

 

3/儲存事項:

① 結合液CB或者抑制(zhì)物去除液IR低(dī)溫時(shí)可(kě)能出現析出和(hé)沉澱,可(kě)以在37℃水(shuǐ)浴幾分鍾幫助重新溶解,恢複澄清透明(míng)後冷卻到室溫即可(kě)使用。

② 為(wèi)避免降低(dī)活性,方便運輸,提供蛋白酶K為(wèi)凍幹粉狀,收到後,可(kě)短(duǎn)暫離心後,加入1毫升滅菌水(shuǐ)溶解,因為(wèi)反複凍融可(kě)能會(huì)降低(dī)酶活性,因此溶解後立即按照每次使用量(20微升)分裝凍存,-20℃保存。

③ 避免試劑長時(shí)間(jiān)暴露于空(kōng)氣中産生(shēng)揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用後應及時(shí)蓋緊蓋子。

 

 

4/産品介紹:

獨特的結合液/蛋白酶K迅速裂解細胞和(hé)滅活細胞內(nèi)核酸酶,然後基因組DNA在高(gāo)離序鹽狀态下選擇性吸附于離心柱內(nèi)矽基質膜, 再通(tōng)過一系列快速的漂洗-離心的步驟,抑制(zhì)物去除液和(hé)漂洗液将細胞代謝物,蛋白等雜質去除, 最後低(dī)鹽的洗脫緩沖液将純淨基因組DNA從矽基質膜上(shàng)洗脫。

 

 

5/産品特點:

① 離心吸附柱內(nèi)矽基質膜全部采用世界著名公司特制(zhì)吸附膜,柱與柱之間(jiān)吸附量差異極小(xiǎo),可(kě)重複性好。

② 不需要使用有(yǒu)毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。

③ 快速,簡捷,單個(gè)樣品操作(zuò)一般可(kě)在30分鍾內(nèi)完成。

④ 多(duō)次柱漂洗确保高(gāo)純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,長度可(kě)達30kb -50kb,可(kě)直接用于PCR,Southern-blot和(hé)各種酶切反應。

 

 

6/注意事項

① 所有(yǒu)的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可(kě)以達到13,000rpm的傳統台式離心機。

② 開(kāi)始實驗前根據需要将水(shuǐ)浴預熱到37℃或者70℃備用。

③ 需要自備異丙醇。

④ 需自備0.5M EDTA、Triton X-100和(hé)Lysozyme(溶菌酶)(用于革蘭氏陽性菌)。

⑤ 結合液CB 和(hé)抑制(zhì)物去除液IR中含有(yǒu)刺激性化合物,操作(zuò)時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和(hé)衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大(dà)量清水(shuǐ)或者生(shēng)理(lǐ)鹽水(shuǐ)沖洗。

⑥ 洗脫液EB不含有(yǒu)螯合劑EDTA,不影(yǐng)響下遊酶切、連接等反應。也可(kě)以使用水(shuǐ)洗脫,但(dàn)應該确保批pH大(dà)于7.5, pH過低(dī)影(yǐng)響洗脫效率。用水(shuǐ)洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可(kě)以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但(dàn)是EDTA可(kě)能影(yǐng)響下遊酶切反應,使用時(shí)可(kě)以适當稀釋。

 

7/操作(zuò)步驟:實驗前請(qǐng)先閱讀注意事項)

提示:第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇,充分混勻,加入後請(qǐng)及時(shí)在方框打鈎标記已加入乙醇,以免多(duō)次加入!

1、取0.5-2毫升培養菌液(最多(duō)不超過2×109個(gè)細胞),10,000rpm,離心30秒(miǎo),盡可(kě)能的吸棄上(shàng)清,收集菌體(tǐ)。

起始處理(lǐ)量可(kě)以根據細菌密度、細胞種類、預期産量進行(xíng)調整,但(dàn)是離心吸附柱最大(dà)吸附能力是20μg基因組DNA,如果菌體(tǐ)過量超過最大(dà)吸附能力,反而會(huì)嚴重降低(dī)産量。

2、加入200μl緩沖液RB重懸,10,000rpm離心30秒(miǎo),棄上(shàng)清。将細胞振蕩或者吹打充分重懸于180μl緩沖液RB中。

注意:對于較難破壁的革蘭氏陽性菌,可(kě)略過第2步驟,加入溶菌酶進行(xíng)破壁處理(lǐ),具體(tǐ)方法為(wèi):加入180 μl緩沖液(20 mM Tris, pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2% Triton X-100;臨用前加入終濃度為(wèi)20 mg/ml的溶菌酶(溶菌酶必須用溶菌酶幹粉溶解在緩沖液中進行(xíng)配制(zhì),否則會(huì)導緻溶菌酶無活性)),37 ℃處理(lǐ)30 min以上(shàng)。

3、加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,再加入200μl 結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在70℃放置10分鍾。

可(kě)選做(zuò)步驟: 如果RNA殘留較多(duō),需要去除RNA,可(kě)以在加入200μl 結合液CB 加4μl RNase A(100mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鍾。

4、冷卻後加入100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時(shí)可(kě)能會(huì)出現絮狀沉澱。

上(shàng)述步驟中立刻渦旋或者吹打充分混勻非常重要,混勻不充分嚴重降低(dī)産量,必要時(shí)如樣品粘稠不易混勻時(shí)可(kě)以渦旋振蕩15秒(miǎo)混勻。

5、将上(shàng)一步混合物(包括可(kě)能有(yǒu)的沉澱)加入一個(gè)吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000 rpm離心30-60秒(miǎo),倒掉收集管CT中的廢液。

6、加入500μl抑制(zhì)物去除液IR,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄廢液。

7、加入600μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇!),12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

8、加入600μl漂洗液WB,12,000 rpm 離心30秒(miǎo),棄掉廢液。

9、将吸附柱DA放回空(kōng)收集管CT中,13,000 rpm離心2分鍾,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制(zhì)下遊反應。

10、取出吸附柱DA,放入一個(gè)幹淨的離心管中,在吸附膜的中間(jiān)部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水(shuǐ)浴中預熱效果更好), 室溫放置3-5分鍾,12,000 rpm 離心1分鍾。将得(de)到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鍾,12,000 rpm離心1分鍾。

洗脫體(tǐ)積越大(dà),洗脫效率越高(gāo),如果需要DNA濃度較高(gāo),可(kě)以适當減少(shǎo)洗脫體(tǐ)積, 但(dàn)是最小(xiǎo)體(tǐ)積不應少(shǎo)于30μl,體(tǐ)積過小(xiǎo)降低(dī)DNA洗脫效率,減少(shǎo)DNA産量。

11、DNA可(kě)以存放在2-8℃,如果要長時(shí)間(jiān)存放,可(kě)以放置在-20℃。

 

 

8/問題與解決方法

問題

評論與建議

DNA産量低(dī)

*蛋白酶K失效了

-建議:收到蛋白酶K後,按照每次使用量分裝凍存,避免反複凍融。

*裂解不完全或者和(hé)異丙醇沒有(yǒu)充分混勻

-建議:加入結合液後,和(hé)加入蛋白酶K後立即吹打或者渦旋混勻;加入異丙醇後立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒(miǎo)充分混勻。

*有(yǒu)的革蘭氏陽性菌需要特殊的酶裂解

-建議:請(qǐng)詳細參見步驟3,了解提取細菌的特性

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘記加無水(shuǐ)乙醇

-建議:第一次實驗時(shí),在漂洗液WB中加入指定量無水(shuǐ)乙醇。

洗脫下來(lái)的
DNA産量低(dī)

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇

-建議:确保做(zuò)了步驟9,否則殘留乙醇會(huì)影(yǐng)響洗脫效率。

*使用了水(shuǐ)或者其它非最佳液體(tǐ)代替洗脫緩沖液

-建議:仔細閱讀仔細閱讀注意事項6和(hé)步驟10和(hé)隻使用洗脫緩沖液EB洗脫。

A260吸光值
異常偏高(gāo)

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),幹擾了吸光值

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

DNA下遊酶切
不能切開(kāi)或者
酶切不完全

*一些(xiē)矽基質膜成分一起洗脫下來(lái),抑制(zhì)了酶切反應

-建議:将洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鍾,小(xiǎo)心取上(shàng)清使用。

*離心柱殘留有(yǒu)較多(duō)乙醇或者底部不慎沾有(yǒu)乙醇抑制(zhì)了酶切反應

-建議:确保做(zuò)了步驟9,然後空(kōng)氣中晾幾分鍾,讓殘留乙醇揮發。